More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0034 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  100 
 
 		 321 aa  665    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  47.62 
 
 		 344 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  45.28 
 
 		 364 aa  296  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  44.13 
 
 		 376 aa  295  9e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  42.72 
 
 		 333 aa  285  7e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  41.32 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  43.09 
 
 		 332 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  43.09 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  43.09 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  42.76 
 
 		 332 aa  278  7e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  42.76 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  42.76 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  42.76 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  42.76 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  42.76 
 
 		 332 aa  278  1e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  42.76 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  41.25 
 
 		 331 aa  275  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  39.43 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  39.43 
 
 		 335 aa  274  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  43.42 
 
 		 332 aa  262  4.999999999999999e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  38.49 
 
 		 321 aa  261  8e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  42.86 
 
 		 412 aa  261  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  40.06 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  46.11 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  42.09 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  39.56 
 
 		 354 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  46.93 
 
 		 363 aa  245  9e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  42.9 
 
 		 353 aa  242  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  39.62 
 
 		 330 aa  219  3e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  39.31 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  36.05 
 
 		 329 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  36.54 
 
 		 326 aa  205  7e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  38.41 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  35.49 
 
 		 334 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  33.88 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  35.42 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  33.55 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  37.5 
 
 		 368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  37.5 
 
 		 368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  35.96 
 
 		 328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  34.83 
 
 		 325 aa  196  6e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  33.44 
 
 		 329 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  33.33 
 
 		 319 aa  192  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  33.23 
 
 		 329 aa  192  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1438  biotin synthase  37.94 
 
 		 354 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.26133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  35.02 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  35.99 
 
 		 350 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  32.44 
 
 		 320 aa  190  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  35.33 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  37.97 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  36.7 
 
 		 370 aa  189  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  39.11 
 
 		 333 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1866  biotin synthase  38.24 
 
 		 354 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260603  decreased coverage  0.000000438605 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  36.56 
 
 		 350 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  37.87 
 
 		 354 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  35.02 
 
 		 350 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  36.49 
 
 		 326 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  35.91 
 
 		 352 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02211  Biotin synthase  37.59 
 
 		 374 aa  186  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  34.92 
 
 		 356 aa  185  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  33.89 
 
 		 333 aa  185  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  34.75 
 
 		 299 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  35.14 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  34.37 
 
 		 388 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  35.02 
 
 		 359 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1311  biotin synthase  35.33 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  29.02 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  35.02 
 
 		 362 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  36.15 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  35.4 
 
 		 360 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  36.4 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  36.4 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  36.4 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  36.76 
 
 		 350 aa  182  7e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  34.93 
 
 		 346 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  35.8 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2345  biotin synthase  36.4 
 
 		 350 aa  181  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.996605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  34.58 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  33.91 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  35.02 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  35.8 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  37.25 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02874  biotin synthase  39.19 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  38.02 
 
 		 349 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  34.59 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  34.24 
 
 		 360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  35.66 
 
 		 368 aa  179  4e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  35.71 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  35.71 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  34.25 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  34.25 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  34.25 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  32.76 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  35.71 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  35.71 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  35.71 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  34.62 
 
 		 321 aa  179  4.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  35.71 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  36.61 
 
 		 361 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  35.71 
 
 		 346 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>