More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0469 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  100 
 
 
354 aa  717    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  69.23 
 
 
353 aa  481  1e-134  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  66.57 
 
 
366 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  66.76 
 
 
363 aa  425  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  60.62 
 
 
412 aa  416  9.999999999999999e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  60.24 
 
 
374 aa  392  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  49.13 
 
 
344 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  47.37 
 
 
332 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  47.37 
 
 
332 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  47.37 
 
 
332 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  47.37 
 
 
332 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  47.37 
 
 
332 aa  317  2e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  47.37 
 
 
332 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  47.37 
 
 
332 aa  316  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  47.06 
 
 
332 aa  315  6e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  47.06 
 
 
332 aa  315  8e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  45.78 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  47.06 
 
 
332 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  46.13 
 
 
332 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  47.87 
 
 
333 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  42.45 
 
 
335 aa  301  9e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  49.21 
 
 
332 aa  301  9e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  42.45 
 
 
335 aa  301  9e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  45.79 
 
 
331 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  42.63 
 
 
321 aa  295  6e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  42.72 
 
 
364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  39.56 
 
 
321 aa  249  4e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  37.3 
 
 
333 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  38.49 
 
 
330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  41.23 
 
 
334 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  33.44 
 
 
331 aa  209  5e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  36.66 
 
 
320 aa  209  7e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  36.08 
 
 
344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  36.86 
 
 
338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  35.94 
 
 
328 aa  195  1e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  38.64 
 
 
340 aa  195  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  37.38 
 
 
333 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0170  biotin synthase  36.02 
 
 
351 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  37.09 
 
 
368 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  37.09 
 
 
368 aa  192  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  38.7 
 
 
316 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  38.7 
 
 
316 aa  192  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  36.88 
 
 
331 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  36.65 
 
 
368 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  34.08 
 
 
326 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  33.13 
 
 
350 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  36.22 
 
 
335 aa  190  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  34.29 
 
 
324 aa  188  1e-46  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  36.66 
 
 
335 aa  188  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  39.86 
 
 
345 aa  188  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  37.37 
 
 
345 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  37.74 
 
 
330 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  32.81 
 
 
325 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  31.27 
 
 
328 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  36.31 
 
 
360 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  34.75 
 
 
341 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2436  biotin synthase  38.46 
 
 
337 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.113139 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1010  biotin synthase  37.73 
 
 
331 aa  186  4e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  35.53 
 
 
349 aa  186  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  37.86 
 
 
361 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  35.5 
 
 
358 aa  186  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  30.96 
 
 
328 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3331  biotin synthase  34.98 
 
 
353 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  35.57 
 
 
342 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  36.86 
 
 
333 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  36.24 
 
 
320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  35.71 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  38.1 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  35.9 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  31.4 
 
 
338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  35.71 
 
 
331 aa  183  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  35.9 
 
 
328 aa  183  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  35.48 
 
 
331 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2776  biotin synthase  32.93 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000782916  normal  0.0347779 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  37.5 
 
 
361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  33.12 
 
 
329 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  33.76 
 
 
350 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  36.59 
 
 
345 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2594  biotin synthase  34.64 
 
 
367 aa  182  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  37.17 
 
 
361 aa  182  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  34.91 
 
 
375 aa  182  7e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  34.47 
 
 
370 aa  182  9.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  35.23 
 
 
375 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  38.38 
 
 
333 aa  181  1e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3396  biotin synthase  38.66 
 
 
336 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.739802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  38.56 
 
 
359 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  33.93 
 
 
351 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2257  biotin synthase  34.91 
 
 
336 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.148943  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  32.12 
 
 
329 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1536  biotin synthase  37.41 
 
 
326 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  34.09 
 
 
347 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0277  biotin synthase  38.26 
 
 
340 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504189  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  35.2 
 
 
362 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  33.76 
 
 
319 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  35.22 
 
 
331 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  36.84 
 
 
361 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  37.37 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  37.28 
 
 
370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  33.53 
 
 
352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  34.42 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>