More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1795 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  100 
 
 		 319 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  50.94 
 
 		 320 aa  325  9e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  48.88 
 
 		 333 aa  319  5e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  47.8 
 
 		 321 aa  315  5e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  49.68 
 
 		 324 aa  309  4e-83  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  45.91 
 
 		 321 aa  302  4.0000000000000003e-81  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  42.41 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  42.32 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  43.73 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  42.68 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  42.59 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  42.31 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  43.23 
 
 		 329 aa  255  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  41.85 
 
 		 364 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  40.59 
 
 		 328 aa  251  8.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  40.59 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  38.99 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  41.64 
 
 		 361 aa  248  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  40.59 
 
 		 324 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  40.78 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  39.3 
 
 		 326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  41.64 
 
 		 330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  45.96 
 
 		 299 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  41.69 
 
 		 334 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  39.57 
 
 		 359 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  38.75 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  38.92 
 
 		 370 aa  233  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  39.8 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  38.61 
 
 		 322 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  39.06 
 
 		 361 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  41.8 
 
 		 331 aa  229  7e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  41.21 
 
 		 370 aa  228  7e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  39.5 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  39.39 
 
 		 361 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  39.06 
 
 		 361 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  38.12 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  37.97 
 
 		 344 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  39.26 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  37.03 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  41.48 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  42.04 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  38.96 
 
 		 368 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  36.45 
 
 		 326 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  40.07 
 
 		 388 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  40.43 
 
 		 337 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0244  Biotin synthase  36.7 
 
 		 319 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.003005  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  36.96 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  36.79 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  39.16 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  37.22 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  38.71 
 
 		 340 aa  210  3e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  38.01 
 
 		 321 aa  209  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  34.62 
 
 		 364 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.03 
 
 		 330 aa  209  6e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  36.91 
 
 		 332 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  35.13 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  35.96 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  35.96 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  35.96 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  35.96 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  35.96 
 
 		 332 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  35.96 
 
 		 332 aa  202  8e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  35.96 
 
 		 332 aa  202  8e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  35.96 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  41.26 
 
 		 337 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  35.65 
 
 		 332 aa  199  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  37.3 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  37.3 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  34.3 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  37.59 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  37.25 
 
 		 326 aa  195  7e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  41.55 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  35.57 
 
 		 341 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  36.12 
 
 		 339 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  35.81 
 
 		 388 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  33.89 
 
 		 334 aa  193  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  33.33 
 
 		 321 aa  192  5e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  35.23 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0246  biotin synthase  33.97 
 
 		 342 aa  192  6e-48  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  41.55 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  33.87 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  35.74 
 
 		 336 aa  190  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  34.56 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  32.9 
 
 		 333 aa  187  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  32.35 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  34.19 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  34.19 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06643  biotin synthase (Eurofung)  36.08 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  33.44 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  34.23 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  33 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  34.56 
 
 		 331 aa  186  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3139  biotin synthase  33.65 
 
 		 350 aa  186  5e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00181497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  33.44 
 
 		 353 aa  185  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  34.32 
 
 		 337 aa  185  9e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  34.65 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0484  biotin synthase  37.94 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  34.86 
 
 		 331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  33.33 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  35.23 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>