More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0112 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  100 
 
 
337 aa  691    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  69.09 
 
 
340 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  68.67 
 
 
337 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  66.17 
 
 
336 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  64.33 
 
 
330 aa  441  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  61.93 
 
 
339 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  59.58 
 
 
337 aa  414  1e-114  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  39.23 
 
 
328 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  39.55 
 
 
328 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  41.91 
 
 
320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  41.61 
 
 
370 aa  217  2e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  38.26 
 
 
328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  37.06 
 
 
329 aa  215  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  37.5 
 
 
322 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  37.38 
 
 
326 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  37.9 
 
 
364 aa  205  7e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  36.86 
 
 
329 aa  203  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  36.63 
 
 
324 aa  202  6e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  37.7 
 
 
328 aa  202  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  39.39 
 
 
329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  37.3 
 
 
333 aa  200  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  39.25 
 
 
375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  37.22 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  35.48 
 
 
361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  36.46 
 
 
299 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  34.46 
 
 
338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  32.59 
 
 
324 aa  192  9e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  35.02 
 
 
359 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  37.7 
 
 
388 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  36.86 
 
 
330 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  33.24 
 
 
368 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  33.05 
 
 
368 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  34.32 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  34.77 
 
 
337 aa  182  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  34.42 
 
 
336 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  34.11 
 
 
321 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  34.54 
 
 
339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  34.54 
 
 
339 aa  179  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  32.37 
 
 
333 aa  179  4e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  34.54 
 
 
339 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  34.54 
 
 
339 aa  179  4e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  34.09 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  32.48 
 
 
332 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  33.23 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  34.54 
 
 
336 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  37.24 
 
 
325 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  34.54 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  34.19 
 
 
344 aa  179  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  33.12 
 
 
333 aa  179  9e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  32.7 
 
 
332 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  34.84 
 
 
326 aa  177  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  32.39 
 
 
332 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  32.39 
 
 
332 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2846  biotin synthase  34.62 
 
 
339 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.699161  normal  0.46425 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  33.76 
 
 
332 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  33.44 
 
 
332 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  37.01 
 
 
327 aa  176  4e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  36.27 
 
 
340 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  35.93 
 
 
321 aa  176  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  32.02 
 
 
332 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  32.02 
 
 
332 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  32.02 
 
 
332 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  32.02 
 
 
332 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  32.02 
 
 
332 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2983  biotin synthase  34.32 
 
 
339 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2949  biotin synthase  35.62 
 
 
339 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.992954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2320  biotin synthase  35.62 
 
 
339 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0133468  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2934  biotin synthase  35.62 
 
 
339 aa  172  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  35.95 
 
 
339 aa  172  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  31.46 
 
 
330 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  33.2 
 
 
321 aa  169  5e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  30.99 
 
 
326 aa  169  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  33.2 
 
 
321 aa  169  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  34.1 
 
 
388 aa  169  8e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  31.23 
 
 
335 aa  167  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0319  biotin synthase  34.3 
 
 
317 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225916  normal  0.0136703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  33.33 
 
 
345 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  35.53 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  33.57 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  32.26 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2164  biotin synthase  31.79 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  31.73 
 
 
321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  36.09 
 
 
332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  31.94 
 
 
362 aa  165  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  33.01 
 
 
345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  34.74 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  36.4 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  30.55 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  30.67 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  32.18 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  33.33 
 
 
339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1536  biotin synthase  33.33 
 
 
326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  32.61 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  32.89 
 
 
316 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  32.01 
 
 
360 aa  163  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  32.89 
 
 
316 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  31.56 
 
 
324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  35.69 
 
 
368 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  32.91 
 
 
335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0444  biotin synthase  32.34 
 
 
361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>