More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2839 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  100 
 
 		 337 aa  691    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  73.41 
 
 		 330 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  71.22 
 
 		 340 aa  503  1e-141  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  69.44 
 
 		 336 aa  474  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  68.67 
 
 		 337 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  65.86 
 
 		 339 aa  459  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  65.58 
 
 		 337 aa  455  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  40.5 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  39.88 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  39.09 
 
 		 370 aa  212  7.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  39.2 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  37.1 
 
 		 329 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  36.68 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  39.13 
 
 		 329 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  42.53 
 
 		 320 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  41.26 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  37.3 
 
 		 329 aa  199  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  36.99 
 
 		 364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  37.5 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  37.92 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  35.78 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  37.84 
 
 		 375 aa  196  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  36.13 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  35.74 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  34.78 
 
 		 333 aa  193  4e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  36.51 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  36.62 
 
 		 325 aa  192  9e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  39.25 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  35.1 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  37.82 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  37.5 
 
 		 368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  35.53 
 
 		 333 aa  190  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  37.3 
 
 		 388 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  35.26 
 
 		 337 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  32.91 
 
 		 326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  35.67 
 
 		 359 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  34.33 
 
 		 324 aa  182  9.000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  35.31 
 
 		 344 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  37.22 
 
 		 330 aa  179  4e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  32.68 
 
 		 331 aa  179  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  35.9 
 
 		 321 aa  179  7e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  33.12 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  32.59 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  33.95 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  34.38 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  33.98 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  33.98 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  34.2 
 
 		 320 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  34.46 
 
 		 341 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  32.25 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  33.55 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  35.19 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  35.19 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  33.79 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  35.19 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  34.15 
 
 		 339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  33.58 
 
 		 331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  33.86 
 
 		 349 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  34.36 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  34.83 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  32.93 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  31.69 
 
 		 332 aa  164  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  33.75 
 
 		 331 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  32.79 
 
 		 321 aa  162  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  33.45 
 
 		 339 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  33.45 
 
 		 327 aa  162  8.000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  33.64 
 
 		 332 aa  162  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03970  biotin synthase, putative  33.72 
 
 		 388 aa  161  1e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.299072  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  33.55 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2101  biotin synthase  33.66 
 
 		 345 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  33.09 
 
 		 362 aa  161  1e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  34.18 
 
 		 335 aa  161  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  31.08 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  31.08 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  32.36 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  31.08 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  31.08 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  31.08 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6278  biotin synthase  33.77 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  31.08 
 
 		 332 aa  161  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  32.72 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  33.09 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  32.71 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  32.96 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  30.79 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  31.95 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  35.47 
 
 		 345 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  33.12 
 
 		 345 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  33.46 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  33.46 
 
 		 322 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0801  biotin synthase  31.14 
 
 		 363 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  33.46 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  33.46 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  33.85 
 
 		 331 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  30.77 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  33.46 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  30.46 
 
 		 332 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  31.79 
 
 		 358 aa  159  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  30.94 
 
 		 354 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  32.81 
 
 		 328 aa  159  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>