More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1435 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  100 
 
 
327 aa  652    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  91.74 
 
 
327 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0484  biotin synthase  86.85 
 
 
327 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.631061  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  67.89 
 
 
338 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  58.92 
 
 
325 aa  365  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  39.81 
 
 
329 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  41.72 
 
 
328 aa  247  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  41.39 
 
 
328 aa  247  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  42.02 
 
 
333 aa  239  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  38.91 
 
 
328 aa  239  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  42.05 
 
 
329 aa  238  8e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  38.83 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  37.29 
 
 
333 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  40.18 
 
 
331 aa  232  5e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  38.75 
 
 
327 aa  232  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  38.14 
 
 
361 aa  228  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  36.57 
 
 
321 aa  226  3e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  40.4 
 
 
321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  38.94 
 
 
328 aa  225  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  40.64 
 
 
332 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  42.39 
 
 
320 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  34.32 
 
 
364 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  38.31 
 
 
321 aa  222  7e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  39.18 
 
 
368 aa  222  8e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  35.84 
 
 
332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  38.18 
 
 
368 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  42.91 
 
 
368 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  41.85 
 
 
322 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  42.12 
 
 
333 aa  219  5e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  37.69 
 
 
388 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  44.32 
 
 
299 aa  219  6e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  33.94 
 
 
324 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  40.85 
 
 
359 aa  218  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  40.58 
 
 
319 aa  218  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  34.34 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  34.34 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  34.34 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  34.34 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  34.34 
 
 
332 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  41.84 
 
 
370 aa  216  5.9999999999999996e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  34.64 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  34.34 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  34.24 
 
 
326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  34.34 
 
 
332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  34.34 
 
 
332 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  39.02 
 
 
337 aa  212  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  34.34 
 
 
332 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  37.8 
 
 
364 aa  210  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  34.71 
 
 
370 aa  208  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  37.68 
 
 
334 aa  208  9e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  37.16 
 
 
320 aa  208  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  39.14 
 
 
324 aa  207  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  34.94 
 
 
361 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  34.44 
 
 
376 aa  205  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  35.26 
 
 
361 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  36.09 
 
 
333 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  34.94 
 
 
361 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  33.22 
 
 
330 aa  204  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  33.22 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  39.26 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  39.26 
 
 
335 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  35.02 
 
 
375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  34.06 
 
 
331 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  33.77 
 
 
316 aa  195  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  36.01 
 
 
321 aa  189  7e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  35.74 
 
 
411 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.63 
 
 
330 aa  188  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  33.33 
 
 
340 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  34.41 
 
 
339 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  31.85 
 
 
341 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  34.01 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  33.44 
 
 
326 aa  180  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  35.69 
 
 
337 aa  179  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  33.33 
 
 
321 aa  179  5.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  30.58 
 
 
412 aa  179  7e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  31.51 
 
 
335 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  33.9 
 
 
353 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0244  Biotin synthase  33.01 
 
 
319 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.003005  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4187  biotin synthase  36.3 
 
 
363 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  29.87 
 
 
349 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  30.67 
 
 
334 aa  175  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  31.45 
 
 
337 aa  173  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  33.33 
 
 
374 aa  172  5e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  30.14 
 
 
331 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  30.93 
 
 
358 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  30 
 
 
331 aa  172  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  29.85 
 
 
337 aa  171  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  31.5 
 
 
331 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4597  biotin synthase  33.22 
 
 
366 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.815308  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  31.51 
 
 
331 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  29.45 
 
 
345 aa  170  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  33.22 
 
 
326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  30.48 
 
 
332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  29 
 
 
331 aa  165  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2430  Biotin synthase  30.98 
 
 
336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  28.79 
 
 
368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  29.86 
 
 
335 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  31.09 
 
 
361 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  32.57 
 
 
324 aa  162  9e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  28.15 
 
 
351 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>