More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1569 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  97.58 
 
 		 331 aa  658    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  100 
 
 		 331 aa  671    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  76.74 
 
 		 335 aa  538  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  78.72 
 
 		 341 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  76.44 
 
 		 331 aa  531  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  75.53 
 
 		 331 aa  522  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  77.81 
 
 		 358 aa  523  1e-147  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  76.44 
 
 		 332 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  76.44 
 
 		 331 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  76.29 
 
 		 345 aa  516  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  74.77 
 
 		 349 aa  517  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  76.44 
 
 		 331 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  76.44 
 
 		 331 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  76.44 
 
 		 331 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  73.33 
 
 		 347 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  75.08 
 
 		 338 aa  500  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0875  biotin synthase  74.47 
 
 		 356 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0984  biotin synthase  74.09 
 
 		 337 aa  487  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  71.12 
 
 		 334 aa  485  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  71.9 
 
 		 339 aa  482  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  75.08 
 
 		 361 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  70.78 
 
 		 335 aa  456  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  41.41 
 
 		 388 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  42.91 
 
 		 368 aa  228  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  42.91 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  36.31 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  41.16 
 
 		 364 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  39.66 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  42.91 
 
 		 370 aa  224  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  38.54 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  41.87 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  34.41 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  39.25 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  38.44 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  36.08 
 
 		 333 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  37.21 
 
 		 376 aa  212  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  40.89 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  40.07 
 
 		 368 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  38.53 
 
 		 328 aa  206  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  36.65 
 
 		 332 aa  206  6e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  34.44 
 
 		 332 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  33.77 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  33.77 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  33.77 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  33.77 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  33.77 
 
 		 332 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  39.66 
 
 		 329 aa  205  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  34.19 
 
 		 331 aa  205  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  42.29 
 
 		 361 aa  205  9e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  39.74 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  41.94 
 
 		 361 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  34.29 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  33.77 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  33.77 
 
 		 332 aa  204  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  40.69 
 
 		 364 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  41.58 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  39.56 
 
 		 326 aa  202  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  33.77 
 
 		 332 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2518  biotin synthase  40.06 
 
 		 354 aa  202  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  36.54 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  33.44 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  39.69 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  41.87 
 
 		 326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  36.33 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  37.54 
 
 		 350 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  36.97 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  36.12 
 
 		 344 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  38.24 
 
 		 345 aa  198  9e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  32.48 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  38.76 
 
 		 327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  38.55 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  38.55 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  34.45 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  34.8 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  35.74 
 
 		 339 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1869  biotin synthase  37.72 
 
 		 325 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0261437  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  33.84 
 
 		 328 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  35.37 
 
 		 322 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  35.55 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  35.74 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  35.37 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  35.37 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  35.37 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  35.37 
 
 		 339 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  32.26 
 
 		 321 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  35.74 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  36.48 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  36.27 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1855  biotin synthase  36.92 
 
 		 350 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  36.48 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  36.67 
 
 		 368 aa  192  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3779  biotin synthase  39.15 
 
 		 353 aa  192  6e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195072  normal  0.526732 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0860  biotin synthase  35.55 
 
 		 350 aa  192  7e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  37.79 
 
 		 351 aa  192  7e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  35.64 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  35.31 
 
 		 352 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  36.92 
 
 		 346 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  38.03 
 
 		 411 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  33.65 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2187  biotin synthase  37.18 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.80903  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>