More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2655 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  100 
 
 		 324 aa  662    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  57.43 
 
 		 361 aa  362  4e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  55.52 
 
 		 364 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  49.83 
 
 		 322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  48.36 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  47.53 
 
 		 329 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  46.77 
 
 		 333 aa  296  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  45.96 
 
 		 329 aa  294  2e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  49.17 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  45.28 
 
 		 328 aa  286  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  44.97 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  48.36 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  46.24 
 
 		 320 aa  261  8e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  49.28 
 
 		 368 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  43.61 
 
 		 334 aa  259  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  47.7 
 
 		 361 aa  258  9e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  47.37 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  48.03 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  45.36 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  41.89 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  39.93 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1753  biotin synthase  41.72 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.65668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  40.59 
 
 		 319 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  41.72 
 
 		 364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  40.4 
 
 		 321 aa  235  8e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  40.51 
 
 		 326 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  40.65 
 
 		 359 aa  232  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  41.28 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  41.31 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  40.67 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  36.36 
 
 		 370 aa  224  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  35.86 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  38.74 
 
 		 333 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  34.29 
 
 		 338 aa  223  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  39.02 
 
 		 324 aa  222  7e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  40.2 
 
 		 331 aa  222  8e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  37.62 
 
 		 376 aa  221  9.999999999999999e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  41.06 
 
 		 341 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  36.63 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  39.63 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  36.25 
 
 		 331 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  40.07 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  34.38 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  37.3 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  37.1 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  37.91 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  39.79 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  38.33 
 
 		 334 aa  216  5.9999999999999996e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  38.46 
 
 		 332 aa  215  7e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  38.41 
 
 		 349 aa  215  8e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  37.58 
 
 		 332 aa  215  9e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  37.58 
 
 		 332 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  37.25 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  37.58 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  37.25 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  37.25 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  37.25 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  37.25 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  37.25 
 
 		 332 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  40.59 
 
 		 358 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  36.39 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  39.93 
 
 		 345 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  35.76 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  36.47 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  38.29 
 
 		 331 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  40.54 
 
 		 332 aa  209  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  39.27 
 
 		 347 aa  206  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  37.55 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  37.55 
 
 		 321 aa  206  5e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  39.74 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  39.27 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  39.23 
 
 		 316 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  38.01 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  39.47 
 
 		 411 aa  203  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  41.92 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  36.63 
 
 		 337 aa  202  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  39.2 
 
 		 331 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1435  biotin synthase  35.4 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183377  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  35.49 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  36.82 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  35.41 
 
 		 337 aa  199  7.999999999999999e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  37.92 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0353  biotin synthase  36.86 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2436  biotin synthase  37.82 
 
 		 337 aa  196  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113139 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  38.01 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  38.01 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  38.01 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  38.44 
 
 		 349 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  34.33 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  39.1 
 
 		 361 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2839  Biotin synthase  36.51 
 
 		 337 aa  192  4e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.33 
 
 		 330 aa  192  9e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  35.17 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  37.37 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0984  biotin synthase  39.13 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265011 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  35.2 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  35.33 
 
 		 321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2756  biotin synthase  34.2 
 
 		 352 aa  189  4e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  33.91 
 
 		 369 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  33.91 
 
 		 352 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>