More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3073 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  95.47 
 
 
331 aa  644    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  100 
 
 
331 aa  671    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  100 
 
 
331 aa  671    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  100 
 
 
331 aa  671    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  96.07 
 
 
331 aa  618  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  89.09 
 
 
349 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  87.92 
 
 
335 aa  603  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  87.23 
 
 
345 aa  578  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  77.04 
 
 
331 aa  536  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  76.44 
 
 
331 aa  535  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  75.23 
 
 
331 aa  528  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  76.6 
 
 
341 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  74.32 
 
 
332 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  75.76 
 
 
347 aa  509  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  74.24 
 
 
358 aa  508  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  74.32 
 
 
338 aa  501  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  72.51 
 
 
339 aa  493  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  69.39 
 
 
334 aa  485  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0967  biotin synthase  74.16 
 
 
361 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00736488  normal  0.128814 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0984  biotin synthase  70.12 
 
 
337 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0875  biotin synthase  69.39 
 
 
356 aa  461  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  71.75 
 
 
335 aa  461  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  42.01 
 
 
368 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  43.92 
 
 
368 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  38.22 
 
 
332 aa  236  4e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  40.07 
 
 
376 aa  235  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  40.54 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  42.09 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  40.84 
 
 
364 aa  233  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  42.38 
 
 
359 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  42.62 
 
 
388 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  37.01 
 
 
332 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  37.01 
 
 
332 aa  226  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  37.01 
 
 
332 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  37.01 
 
 
332 aa  226  4e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  37.42 
 
 
320 aa  226  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  37.01 
 
 
332 aa  226  4e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  39.68 
 
 
329 aa  226  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  40.94 
 
 
329 aa  225  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  37.14 
 
 
332 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  37.14 
 
 
332 aa  225  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  37.3 
 
 
332 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  37.01 
 
 
332 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  42.04 
 
 
364 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  42.91 
 
 
368 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  41.16 
 
 
322 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  36.36 
 
 
332 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  39.4 
 
 
324 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  37.12 
 
 
333 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  38.98 
 
 
332 aa  216  4e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  35.24 
 
 
333 aa  216  4e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3603  biotin synthase  44.29 
 
 
361 aa  215  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  39.55 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3535  biotin synthase  43.93 
 
 
361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.26843  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3453  biotin synthase  43.93 
 
 
361 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.068141  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  40.07 
 
 
329 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  35.76 
 
 
331 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  38.06 
 
 
328 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  37.74 
 
 
328 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  38.63 
 
 
328 aa  209  8e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  39.88 
 
 
361 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  39.93 
 
 
330 aa  206  3e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  34.53 
 
 
321 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1869  biotin synthase  40.29 
 
 
325 aa  206  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0261437  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  35.18 
 
 
331 aa  204  1e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  34.84 
 
 
321 aa  204  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  37.2 
 
 
349 aa  203  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  38.34 
 
 
328 aa  203  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2097  biotin synthase  39.67 
 
 
347 aa  202  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.178229  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  33.55 
 
 
335 aa  202  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  33.55 
 
 
335 aa  202  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  37.63 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  37.63 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  39.22 
 
 
331 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  40.07 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  40.82 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  38.83 
 
 
412 aa  199  3.9999999999999996e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  37.62 
 
 
350 aa  199  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  36.72 
 
 
344 aa  199  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  38.11 
 
 
327 aa  199  7e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1129  biotin synthase  39.8 
 
 
342 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  35.22 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  37.16 
 
 
360 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2518  biotin synthase  40.53 
 
 
354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  39.1 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  35.85 
 
 
326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  36.88 
 
 
339 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4030  biotin synthase  39.12 
 
 
345 aa  196  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.959642 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  36.88 
 
 
339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  36.88 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  36.88 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  36.88 
 
 
339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  37.16 
 
 
359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  36.88 
 
 
339 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  36.88 
 
 
339 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  37.16 
 
 
362 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  36.88 
 
 
336 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0117  biotin synthase  39.22 
 
 
345 aa  195  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0814388  normal  0.975833 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  37.98 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  34.08 
 
 
324 aa  195  9e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>