109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1674 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1674  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  715    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1545  Radical SAM domain protein  32.34 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.160602  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  27.69 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  26.84 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  28.14 
 
 		 341 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  25.97 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  26.57 
 
 		 341 aa  102  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  28.09 
 
 		 344 aa  99.4  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  24.53 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  23.77 
 
 		 349 aa  66.2  0.0000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  23.95 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  24.06 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  24.07 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 347 aa  60.1  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  22.89 
 
 		 330 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  26.47 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  25 
 
 		 352 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  24.64 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  20.61 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 390 aa  58.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  24.61 
 
 		 826 aa  56.6  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  21.85 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  21.7 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  23.99 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  22.45 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  24.7 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  22.78 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  22.11 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  20.93 
 
 		 332 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  26.27 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.83 
 
 		 481 aa  53.5  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  23.62 
 
 		 347 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.59 
 
 		 466 aa  53.1  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  25.98 
 
 		 352 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  25.49 
 
 		 352 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  23.02 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.63 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  25.96 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  22.45 
 
 		 365 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.03 
 
 		 464 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  23.58 
 
 		 311 aa  50.1  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0709  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.18 
 
 		 353 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  25.19 
 
 		 392 aa  49.7  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  25.74 
 
 		 324 aa  49.7  0.00008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1990  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.77 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.84 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  22.31 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  24.51 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.95 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.68 
 
 		 458 aa  47.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.45 
 
 		 478 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  22.79 
 
 		 412 aa  47.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.83 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  21.77 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  31.75 
 
 		 479 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  31.75 
 
 		 479 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  22.22 
 
 		 292 aa  46.6  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1269  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.09 
 
 		 344 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00918784  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5067  biotin synthase  21.66 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.51 
 
 		 437 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  21.14 
 
 		 360 aa  45.4  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  24.1 
 
 		 497 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3455  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  31.13 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207743  normal  0.273738 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4006  biotin synthase  21.43 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  21.74 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0904  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.81 
 
 		 373 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0102552  normal  0.0824176 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2615  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  27.19 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3764  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  31.13 
 
 		 474 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4375  biotin synthase  21.43 
 
 		 335 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.26 
 
 		 467 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1614  Radical SAM domain protein  31.21 
 
 		 471 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1039  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.18 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4668  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.98 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0326  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.36 
 
 		 318 aa  44.3  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10931  biotin synthase  21.22 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.894621  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4885  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.6 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.831763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 364 aa  44.3  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  21.68 
 
 		 384 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.49 
 
 		 469 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1288  molybdenum cofactor synthesis protein  23.6 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02695  Biotin synthase  17.72 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.175174  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3477  hypothetical protein  25.79 
 
 		 359 aa  43.9  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.81 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.58 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  20 
 
 		 326 aa  43.5  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  24.34 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.11 
 
 		 490 aa  43.5  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4487  biotin synthase  20.78 
 
 		 341 aa  43.9  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.487965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0369  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.75 
 
 		 321 aa  43.5  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000001817  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0560  Radical SAM domain protein  22.87 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  26.22 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  21.94 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1779  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.97 
 
 		 476 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2120  radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 476 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.323478  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  24.3 
 
 		 388 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  23.08 
 
 		 347 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  21.92 
 
 		 349 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1468  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.68 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.724446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>