More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1244 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  100 
 
 
360 aa  734    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  50.88 
 
 
354 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  49.4 
 
 
345 aa  352  7e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  51.64 
 
 
347 aa  350  2e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  51.64 
 
 
347 aa  350  3e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  60.24 
 
 
370 aa  349  4e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  53.78 
 
 
348 aa  345  8e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  53.31 
 
 
344 aa  343  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  55.62 
 
 
348 aa  340  2e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  48.55 
 
 
350 aa  337  1.9999999999999998e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  51.8 
 
 
349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  52.34 
 
 
349 aa  335  5e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  45.71 
 
 
351 aa  331  1e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  53.39 
 
 
350 aa  330  2e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  47.21 
 
 
352 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  52.94 
 
 
352 aa  316  3e-85  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  46.13 
 
 
341 aa  317  3e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  46.88 
 
 
346 aa  310  2e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  45.48 
 
 
353 aa  279  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  43.2 
 
 
372 aa  279  5e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  40.59 
 
 
345 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  45.75 
 
 
360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  43.44 
 
 
348 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  37.8 
 
 
380 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  44.72 
 
 
356 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  46.13 
 
 
374 aa  259  4e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  43.11 
 
 
357 aa  258  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  48.65 
 
 
323 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  42.01 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  42.21 
 
 
347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  45.62 
 
 
351 aa  250  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  53.21 
 
 
331 aa  249  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  42.14 
 
 
337 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  41.23 
 
 
359 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  41.49 
 
 
359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  45.45 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  45.22 
 
 
311 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  34.67 
 
 
364 aa  215  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  30.23 
 
 
368 aa  124  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  30.72 
 
 
350 aa  122  8e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  30.54 
 
 
365 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  29.63 
 
 
350 aa  119  9e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.92 
 
 
473 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.92 
 
 
473 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.77 
 
 
477 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  27.46 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.66 
 
 
481 aa  90.1  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  30.38 
 
 
359 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  26.81 
 
 
341 aa  87  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  31.06 
 
 
388 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.63 
 
 
458 aa  86.3  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  28.33 
 
 
368 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  26.45 
 
 
341 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.42 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.26 
 
 
469 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.68 
 
 
466 aa  84.3  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  26.47 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.88 
 
 
489 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  26.81 
 
 
341 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  28.33 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  26.81 
 
 
341 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  28.92 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.62 
 
 
484 aa  82.4  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  28.24 
 
 
321 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  28.76 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  26.64 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.65 
 
 
471 aa  81.3  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  24.84 
 
 
474 aa  81.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  29.77 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.68 
 
 
469 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.74 
 
 
471 aa  79.7  0.00000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  26.88 
 
 
475 aa  79.7  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.94 
 
 
467 aa  79.7  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  28.87 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.27 
 
 
487 aa  78.6  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  29.12 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  27.65 
 
 
376 aa  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.04 
 
 
490 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  27.88 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.34 
 
 
473 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.48 
 
 
471 aa  77  0.0000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  26.83 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.48 
 
 
473 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.52 
 
 
463 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.38 
 
 
468 aa  75.9  0.0000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.42 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  25 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  28.99 
 
 
366 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.23 
 
 
374 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  30.1 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.57 
 
 
472 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.36 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.94 
 
 
370 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.44 
 
 
479 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.51 
 
 
472 aa  73.9  0.000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  24.91 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.74 
 
 
474 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  24.91 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  26.37 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  25.18 
 
 
472 aa  72.8  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>