179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1599 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  72.82 
 
 
473 aa  729    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 
471 aa  962    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  76.43 
 
 
469 aa  756    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  73.25 
 
 
471 aa  730    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  67.16 
 
 
471 aa  659    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.58 
 
 
474 aa  551  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.61 
 
 
487 aa  549  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  54.89 
 
 
472 aa  549  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  58.41 
 
 
473 aa  545  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.08 
 
 
492 aa  535  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.17 
 
 
491 aa  534  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.27 
 
 
469 aa  528  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.63 
 
 
479 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.53 
 
 
479 aa  500  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.42 
 
 
479 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.59 
 
 
481 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.7 
 
 
490 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.52 
 
 
477 aa  478  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.13 
 
 
467 aa  477  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.86 
 
 
466 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.78 
 
 
469 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.91 
 
 
464 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  47.7 
 
 
475 aa  462  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.83 
 
 
473 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.47 
 
 
473 aa  460  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.95 
 
 
489 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.25 
 
 
458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.87 
 
 
458 aa  451  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.4 
 
 
465 aa  443  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  50 
 
 
467 aa  441  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  49.03 
 
 
474 aa  434  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.06 
 
 
468 aa  432  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.22 
 
 
470 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.93 
 
 
472 aa  422  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.19 
 
 
484 aa  405  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.82 
 
 
472 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.31 
 
 
463 aa  292  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.05 
 
 
374 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.66 
 
 
370 aa  203  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.2 
 
 
376 aa  202  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.43 
 
 
367 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.08 
 
 
381 aa  189  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.84 
 
 
414 aa  187  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.14 
 
 
356 aa  186  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.15 
 
 
367 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.93 
 
 
372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  33.43 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.12 
 
 
371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.94 
 
 
369 aa  184  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.61 
 
 
381 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.12 
 
 
371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.52 
 
 
369 aa  183  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.62 
 
 
381 aa  183  6e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.63 
 
 
375 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4402  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.26 
 
 
377 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.12 
 
 
371 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.4 
 
 
369 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.99 
 
 
378 aa  182  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.82 
 
 
371 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.12 
 
 
371 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2388  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.34 
 
 
390 aa  180  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.97 
 
 
381 aa  179  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4369  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.89 
 
 
377 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.96 
 
 
371 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.26 
 
 
377 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  29.89 
 
 
366 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.06 
 
 
378 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1855  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.13 
 
 
371 aa  177  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5457  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.39 
 
 
377 aa  176  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0848103 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.39 
 
 
377 aa  176  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4565  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.97 
 
 
377 aa  176  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453457 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.82 
 
 
371 aa  176  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.62908 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  29.39 
 
 
377 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.39 
 
 
377 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0342  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.69 
 
 
376 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.17 
 
 
389 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4489  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.68 
 
 
377 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456857 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.19 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.52 
 
 
371 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.61 
 
 
370 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.08 
 
 
369 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.18 
 
 
370 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3857  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.69 
 
 
376 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4480  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.11 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.99 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.52 
 
 
371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.45 
 
 
383 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4223  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.11 
 
 
377 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03866  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.11 
 
 
377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2587  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.91 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.914294  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  31.91 
 
 
378 aa  174  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0046  thiH protein  28.99 
 
 
382 aa  174  3.9999999999999995e-42  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.081488  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.22 
 
 
368 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.3 
 
 
367 aa  173  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4437  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.39 
 
 
377 aa  173  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208104 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.85 
 
 
377 aa  173  5.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2018  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.53 
 
 
374 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.705115 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.52 
 
 
377 aa  172  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3720  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.94 
 
 
377 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.526508  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  28 
 
 
386 aa  171  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>