179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1504 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  100 
 
 		 331 aa  669    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  60.63 
 
 		 323 aa  362  6e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  47.81 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  46.8 
 
 		 347 aa  256  5e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  46.8 
 
 		 347 aa  255  9e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  46.58 
 
 		 349 aa  252  5.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  46.28 
 
 		 356 aa  252  6e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  41.8 
 
 		 380 aa  252  7e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  43.87 
 
 		 351 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  44.07 
 
 		 345 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  53.21 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  50.84 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  43.92 
 
 		 346 aa  246  4e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  46.62 
 
 		 341 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  45.14 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  47.02 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  42.03 
 
 		 353 aa  239  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  44.79 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  46.86 
 
 		 350 aa  239  6.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  46.1 
 
 		 348 aa  238  8e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  44.93 
 
 		 352 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  45.14 
 
 		 360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  45.02 
 
 		 352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  46.26 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  42.32 
 
 		 372 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  45.58 
 
 		 349 aa  230  3e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  48.32 
 
 		 370 aa  225  8e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  41.16 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  43.48 
 
 		 359 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  42.14 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  44.21 
 
 		 357 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  42.95 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  42.42 
 
 		 359 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  47.99 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  39.33 
 
 		 364 aa  219  5e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  39.33 
 
 		 311 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  42.65 
 
 		 351 aa  209  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  38.38 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  30.65 
 
 		 365 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  28.17 
 
 		 350 aa  97.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 		 368 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  28.38 
 
 		 350 aa  92.4  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  28.45 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.2 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.61 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.61 
 
 		 473 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.81 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  22.68 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  21.96 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.54 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  23.32 
 
 		 341 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.37 
 
 		 481 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  22.22 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.85 
 
 		 471 aa  60.1  0.00000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.11 
 
 		 473 aa  59.7  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0046  thiH protein  24.41 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.081488  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.88 
 
 		 466 aa  59.3  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.28 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  25.09 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.51 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.74 
 
 		 491 aa  57  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.03 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.57 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  24.69 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  29.19 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.78 
 
 		 472 aa  56.2  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.62 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.93 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  25.39 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.13 
 
 		 469 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.65 
 
 		 492 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.17 
 
 		 473 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  28.48 
 
 		 369 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.19 
 
 		 468 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.15 
 
 		 471 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  26.94 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.02 
 
 		 469 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.11 
 
 		 470 aa  53.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  24.9 
 
 		 347 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  24.4 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  22.44 
 
 		 472 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2296  biotin synthase  24.62 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.966157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  23.74 
 
 		 370 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.71 
 
 		 489 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  24.89 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  28.03 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.14 
 
 		 474 aa  50.8  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2655  biotin synthase  27 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.797628  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.09 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.09 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  28.64 
 
 		 826 aa  50.4  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.82 
 
 		 372 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  23.94 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  23.55 
 
 		 353 aa  50.1  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  29.56 
 
 		 371 aa  50.1  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  29.44 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.09 
 
 		 371 aa  50.1  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  26.94 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.32 
 
 		 373 aa  49.3  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.75 
 
 		 414 aa  49.3  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>