More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4857 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 365 aa  763    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  54.21 
 
 		 368 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  43.9 
 
 		 350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  40.17 
 
 		 350 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  33.78 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  31.1 
 
 		 354 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  32.09 
 
 		 350 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  31.86 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  32.65 
 
 		 352 aa  137  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  31.97 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  31.97 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  29.55 
 
 		 359 aa  126  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  28.67 
 
 		 372 aa  126  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  28.67 
 
 		 341 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  29.33 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  30.67 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 		 349 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  30.67 
 
 		 348 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  29.51 
 
 		 359 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  31.44 
 
 		 344 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  30.54 
 
 		 360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  30.03 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  29.86 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 		 370 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  30.36 
 
 		 337 aa  119  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  31.79 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  27 
 
 		 351 aa  118  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 346 aa  118  1.9999999999999998e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  28.98 
 
 		 337 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 347 aa  116  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  27.16 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  29.61 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  28.57 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  24.78 
 
 		 353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  28.68 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 374 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  23.7 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  23.33 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  23.7 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  23.55 
 
 		 341 aa  99.8  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  30.65 
 
 		 331 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  29.47 
 
 		 348 aa  99.4  9e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  23.21 
 
 		 344 aa  95.9  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  26.8 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.06 
 
 		 473 aa  90.9  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.06 
 
 		 473 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.59 
 
 		 472 aa  89.4  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.27 
 
 		 470 aa  89  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  22.85 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.16 
 
 		 466 aa  85.9  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  27.69 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  25 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.27 
 
 		 472 aa  82.8  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  28.69 
 
 		 475 aa  81.3  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.37 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  24.54 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  25 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.64 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.24 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.42 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.24 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0215  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.67 
 
 		 373 aa  74.3  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.53 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.67 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.14 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.48 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  26.52 
 
 		 368 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4138  biotin synthase  25.66 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4023  biotin synthase  25.66 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3856  biotin synthase  25.66 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3870  biotin synthase  25.66 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4336  biotin synthase  25.66 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.54 
 
 		 479 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  24.32 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  26.98 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  24.32 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  26.94 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.68 
 
 		 479 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  24.58 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.28 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.21 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1012  biotin synthase  25.28 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.91 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  23.7 
 
 		 333 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3946  biotin synthase  25.28 
 
 		 332 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.57 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.52 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  22.79 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  28.64 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  23.95 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.7 
 
 		 489 aa  69.7  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4225  biotin synthase  25.28 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.911931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  26.39 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.85 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4248  biotin synthase  24.91 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  24.73 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4184  biotin synthase  24.91 
 
 		 332 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.48 
 
 		 377 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>