171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16500 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  64.69 
 
 		 472 aa  636    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 		 484 aa  1008    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  65.49 
 
 		 472 aa  650    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  59.58 
 
 		 470 aa  578  1.0000000000000001e-163  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  57.8 
 
 		 474 aa  568  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.24 
 
 		 477 aa  503  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.72 
 
 		 469 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  52.62 
 
 		 475 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.52 
 
 		 489 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.96 
 
 		 466 aa  480  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.16 
 
 		 473 aa  465  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.95 
 
 		 473 aa  464  1e-129  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.53 
 
 		 467 aa  461  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.32 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.9 
 
 		 473 aa  422  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.38 
 
 		 481 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.77 
 
 		 471 aa  420  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.46 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.11 
 
 		 469 aa  418  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.31 
 
 		 479 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.86 
 
 		 479 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.19 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.94 
 
 		 479 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.97 
 
 		 469 aa  405  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.17 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.82 
 
 		 473 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.2 
 
 		 464 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.24 
 
 		 487 aa  391  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.53 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.21 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.44 
 
 		 491 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.83 
 
 		 492 aa  385  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  45.79 
 
 		 472 aa  384  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.54 
 
 		 471 aa  383  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.72 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.02 
 
 		 465 aa  360  4e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.99 
 
 		 463 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.22 
 
 		 369 aa  201  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.22 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.24 
 
 		 367 aa  193  6e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.65 
 
 		 356 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.83 
 
 		 374 aa  190  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0664  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.15 
 
 		 355 aa  190  5.999999999999999e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.428424  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.58 
 
 		 354 aa  189  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.03 
 
 		 385 aa  188  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.47 
 
 		 367 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1566  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.95 
 
 		 363 aa  186  7e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0773107 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.99 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.81 
 
 		 376 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.25 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.09 
 
 		 366 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  34.8 
 
 		 368 aa  181  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.54 
 
 		 389 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.86 
 
 		 369 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.07 
 
 		 366 aa  177  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.1 
 
 		 370 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.81 
 
 		 370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1557  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.82 
 
 		 356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.190528  normal  0.123415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.56 
 
 		 383 aa  171  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.01 
 
 		 372 aa  170  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.91 
 
 		 381 aa  169  7e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  29.86 
 
 		 378 aa  169  7e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.18 
 
 		 381 aa  169  8e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.91 
 
 		 381 aa  169  9e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2462  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.25 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.72 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.53 
 
 		 374 aa  167  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  30.57 
 
 		 371 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.3 
 
 		 379 aa  163  6e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.23 
 
 		 372 aa  163  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1137  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.49 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.867554  normal  0.132743 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.94 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.12 
 
 		 378 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.9 
 
 		 378 aa  160  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1278  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.18 
 
 		 384 aa  160  5e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.173544  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3075  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.41 
 
 		 388 aa  160  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0728  thiazole biosynthesis protein ThiH  33.76 
 
 		 372 aa  158  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00541403  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.93 
 
 		 377 aa  157  3e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.43 
 
 		 370 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002077  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.92 
 
 		 370 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2587  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.08 
 
 		 369 aa  156  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.914294  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.69 
 
 		 371 aa  156  8e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2388  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.61 
 
 		 390 aa  156  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00361  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.39 
 
 		 375 aa  156  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1855  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.13 
 
 		 371 aa  156  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.03 
 
 		 369 aa  155  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1868  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.75 
 
 		 384 aa  155  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.386281  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.33 
 
 		 371 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0365  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.46 
 
 		 372 aa  154  4e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.13 
 
 		 368 aa  153  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.03 
 
 		 371 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.42 
 
 		 378 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.98 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.12 
 
 		 371 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.03 
 
 		 371 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.84 
 
 		 377 aa  151  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.73 
 
 		 371 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.12 
 
 		 371 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2988  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.29 
 
 		 370 aa  150  6e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.61 
 
 		 373 aa  149  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>