217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1631 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 
474 aa  976    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  74.26 
 
 
473 aa  730    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.86 
 
 
473 aa  558  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  58.66 
 
 
471 aa  554  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.58 
 
 
471 aa  551  1e-155  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  56.71 
 
 
469 aa  551  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.17 
 
 
471 aa  545  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.13 
 
 
492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  54.43 
 
 
472 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.89 
 
 
491 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.45 
 
 
469 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.29 
 
 
479 aa  478  1e-134  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.86 
 
 
479 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.21 
 
 
479 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.25 
 
 
487 aa  468  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  50 
 
 
490 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.46 
 
 
469 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.51 
 
 
477 aa  448  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.88 
 
 
481 aa  442  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.57 
 
 
458 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.05 
 
 
464 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  47.42 
 
 
475 aa  436  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.01 
 
 
473 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.01 
 
 
473 aa  437  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.27 
 
 
466 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.4 
 
 
489 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.51 
 
 
467 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.14 
 
 
468 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  44.33 
 
 
474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.68 
 
 
458 aa  403  1e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.67 
 
 
467 aa  401  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.78 
 
 
472 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.17 
 
 
484 aa  397  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.89 
 
 
470 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.89 
 
 
472 aa  390  1e-107  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.16 
 
 
465 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.85 
 
 
463 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.05 
 
 
374 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.33 
 
 
370 aa  194  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.8 
 
 
376 aa  192  1e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2388  thiazole biosynthesis protein ThiH  33.24 
 
 
390 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.33 
 
 
356 aa  187  5e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  31.62 
 
 
378 aa  186  9e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.19 
 
 
383 aa  186  9e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  34.34 
 
 
378 aa  183  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.18 
 
 
370 aa  180  4.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3075  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.42 
 
 
388 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  33.23 
 
 
369 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.98 
 
 
372 aa  177  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.12 
 
 
367 aa  176  6e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.84 
 
 
378 aa  176  7e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.3 
 
 
371 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.3 
 
 
371 aa  176  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  31.62 
 
 
371 aa  176  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.3 
 
 
371 aa  176  9e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.3 
 
 
371 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.58 
 
 
372 aa  175  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2462  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.7 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.3 
 
 
371 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.13 
 
 
414 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.99 
 
 
375 aa  173  5e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.3 
 
 
371 aa  174  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.9 
 
 
378 aa  174  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.51 
 
 
369 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.23 
 
 
371 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.14 
 
 
369 aa  172  9e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1566  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.75 
 
 
363 aa  172  1e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0773107 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.49 
 
 
389 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.56 
 
 
367 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.23 
 
 
371 aa  172  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.92 
 
 
371 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.61 
 
 
354 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0664  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.73 
 
 
355 aa  171  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.428424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0202  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.97 
 
 
377 aa  171  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5457  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.8 
 
 
377 aa  170  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0848103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.86 
 
 
369 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.8 
 
 
377 aa  170  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  29.8 
 
 
377 aa  170  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.8 
 
 
377 aa  170  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3720  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.16 
 
 
377 aa  169  7e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.526508  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0046  thiH protein  30.66 
 
 
382 aa  169  8e-41  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.081488  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03866  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.51 
 
 
377 aa  169  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4223  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.51 
 
 
377 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4480  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.51 
 
 
377 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4437  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.8 
 
 
377 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208104 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4489  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.09 
 
 
377 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456857 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.71 
 
 
366 aa  168  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.41 
 
 
367 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.37 
 
 
377 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.37 
 
 
373 aa  167  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4369  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.04 
 
 
377 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.82 
 
 
370 aa  167  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4402  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.8 
 
 
377 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002077  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.09 
 
 
370 aa  166  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.09 
 
 
377 aa  166  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0215  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.37 
 
 
373 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.68 
 
 
368 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.66 
 
 
381 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4565  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.8 
 
 
377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453457 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03819  hypothetical protein  29.23 
 
 
377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>