180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0842 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  69.79 
 
 		 469 aa  684    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 		 468 aa  967    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  62.47 
 
 		 489 aa  632  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  61.54 
 
 		 466 aa  620  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  62.45 
 
 		 477 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  62.5 
 
 		 467 aa  588  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  59.7 
 
 		 475 aa  578  1e-164  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  56.25 
 
 		 473 aa  558  1e-158  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  56.25 
 
 		 473 aa  560  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  53.45 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.53 
 
 		 470 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.59 
 
 		 472 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.43 
 
 		 458 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.5 
 
 		 481 aa  487  1e-136  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.46 
 
 		 473 aa  478  1e-134  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.03 
 
 		 471 aa  476  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.77 
 
 		 490 aa  475  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.48 
 
 		 464 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.32 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.4 
 
 		 472 aa  472  1e-132  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.32 
 
 		 484 aa  469  1.0000000000000001e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.68 
 
 		 467 aa  463  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.53 
 
 		 492 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.07 
 
 		 479 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.21 
 
 		 491 aa  452  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.96 
 
 		 479 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.06 
 
 		 471 aa  449  1e-125  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.35 
 
 		 487 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.96 
 
 		 479 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.79 
 
 		 469 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  46 
 
 		 471 aa  442  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.16 
 
 		 458 aa  443  1e-123  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  46.98 
 
 		 472 aa  433  1e-120  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.14 
 
 		 474 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  47 
 
 		 473 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.1 
 
 		 465 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.35 
 
 		 463 aa  258  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.2 
 
 		 374 aa  223  8e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.88 
 
 		 369 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.76 
 
 		 370 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.91 
 
 		 376 aa  207  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  36 
 
 		 356 aa  206  9e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  34.74 
 
 		 366 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.61 
 
 		 367 aa  203  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.69 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.97 
 
 		 389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.83 
 
 		 369 aa  199  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.43 
 
 		 386 aa  199  9e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.06 
 
 		 367 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.93 
 
 		 370 aa  196  6e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.25 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.49 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  33.33 
 
 		 383 aa  195  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.84 
 
 		 369 aa  194  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.95 
 
 		 381 aa  194  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.9 
 
 		 381 aa  194  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.21 
 
 		 366 aa  192  9e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0664  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.73 
 
 		 355 aa  192  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.428424  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.07 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.76 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.64 
 
 		 367 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.75 
 
 		 369 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1137  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.65 
 
 		 430 aa  189  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.867554  normal  0.132743 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1566  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.72 
 
 		 363 aa  189  9e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0773107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3075  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.04 
 
 		 388 aa  188  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  35 
 
 		 378 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.61 
 
 		 372 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.36 
 
 		 377 aa  186  1.0000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2587  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.82 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.914294  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.44 
 
 		 369 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.99 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.83 
 
 		 370 aa  184  4.0000000000000006e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.53 
 
 		 378 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1868  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.83 
 
 		 384 aa  183  6e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.386281  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2462  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.34 
 
 		 372 aa  182  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.93 
 
 		 371 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.24 
 
 		 354 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.73 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.77 
 
 		 377 aa  182  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.1 
 
 		 374 aa  182  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.77 
 
 		 377 aa  182  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5457  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.77 
 
 		 377 aa  182  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0848103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.95 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.9 
 
 		 370 aa  182  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.93 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.77 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.95 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.63 
 
 		 371 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.25 
 
 		 381 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4480  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.49 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4223  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.49 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03866  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.49 
 
 		 377 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0728  thiazole biosynthesis protein ThiH  33.62 
 
 		 372 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00541403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2018  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.93 
 
 		 374 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.705115 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.57 
 
 		 371 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.95 
 
 		 371 aa  179  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.63 
 
 		 368 aa  179  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  32.58 
 
 		 371 aa  179  8e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4437  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.85 
 
 		 377 aa  179  8e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208104 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1278  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.82 
 
 		 384 aa  179  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.173544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>