More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0240 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  100 
 
 		 349 aa  717    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  71.22 
 
 		 341 aa  509  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  64.58 
 
 		 348 aa  411  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  63.81 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  55 
 
 		 345 aa  379  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  53.03 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  52.73 
 
 		 347 aa  363  3e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  54.23 
 
 		 351 aa  359  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  52.96 
 
 		 350 aa  355  8.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  52.57 
 
 		 352 aa  338  9e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  51.86 
 
 		 350 aa  332  5e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  52.34 
 
 		 360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  47.69 
 
 		 349 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  47.71 
 
 		 346 aa  317  2e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  47.71 
 
 		 354 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  47.78 
 
 		 372 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  48.14 
 
 		 370 aa  297  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  47 
 
 		 344 aa  296  4e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  46.76 
 
 		 353 aa  293  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  46.32 
 
 		 347 aa  292  5e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  46.92 
 
 		 348 aa  289  4e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  46.35 
 
 		 356 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  50.52 
 
 		 352 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  44.85 
 
 		 337 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  43.58 
 
 		 345 aa  278  8e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  44.05 
 
 		 357 aa  275  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  46.85 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  44.21 
 
 		 360 aa  268  7e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  45.51 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  44.95 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  47.16 
 
 		 374 aa  263  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  46.26 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  44.84 
 
 		 359 aa  255  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  43.73 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  46.58 
 
 		 331 aa  246  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  37.64 
 
 		 364 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  45.65 
 
 		 337 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  44.32 
 
 		 311 aa  235  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  32.99 
 
 		 350 aa  126  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  32.14 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  29.85 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 365 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.01 
 
 		 470 aa  94.4  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  28.41 
 
 		 474 aa  92.4  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  27.27 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.21 
 
 		 472 aa  89.7  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  27.65 
 
 		 341 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.46 
 
 		 473 aa  87.4  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  26.04 
 
 		 475 aa  85.5  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.11 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  27 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.8 
 
 		 473 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.48 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.8 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.34 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  29.01 
 
 		 328 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.52 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.95 
 
 		 469 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.69 
 
 		 466 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.47 
 
 		 458 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.59 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.35 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  26.74 
 
 		 341 aa  79.7  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  29.65 
 
 		 344 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.59 
 
 		 490 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.6 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.24 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.98 
 
 		 369 aa  76.3  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  29.75 
 
 		 344 aa  75.9  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.63 
 
 		 381 aa  75.9  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.07 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  30 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  30 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.16 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.24 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.07 
 
 		 473 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.1 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.03 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.62 
 
 		 469 aa  72.8  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.59 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1278  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.82 
 
 		 384 aa  72  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.173544  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  29.31 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.32 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.37 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.58 
 
 		 367 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  29.31 
 
 		 335 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  27.51 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.78 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  30.04 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  26.71 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.91 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.52 
 
 		 467 aa  70.5  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.44 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.58 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.75 
 
 		 481 aa  69.3  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  25.42 
 
 		 328 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  26.77 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.26 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  26.09 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1137  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.59 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.867554  normal  0.132743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>