More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1020 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  100 
 
 		 311 aa  646    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  46.69 
 
 		 364 aa  300  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  43.83 
 
 		 351 aa  256  2e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  47.41 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  47.41 
 
 		 353 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  45.02 
 
 		 345 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  44.81 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  42.59 
 
 		 346 aa  242  6e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  46.3 
 
 		 349 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  43.33 
 
 		 347 aa  239  4e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  43.33 
 
 		 347 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  43.7 
 
 		 347 aa  236  4e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  44.32 
 
 		 349 aa  235  9e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  45.19 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  42.75 
 
 		 345 aa  229  6e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  46.67 
 
 		 348 aa  229  6e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  46.3 
 
 		 348 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  39.94 
 
 		 356 aa  225  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  45.22 
 
 		 360 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  40.48 
 
 		 351 aa  224  1e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  43.38 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  41.94 
 
 		 360 aa  222  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  41.11 
 
 		 323 aa  222  7e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  40.13 
 
 		 348 aa  221  9e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  41.11 
 
 		 380 aa  221  1.9999999999999999e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  40.91 
 
 		 354 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  43.45 
 
 		 352 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  44.44 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  41.78 
 
 		 337 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  44.44 
 
 		 370 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  37.46 
 
 		 357 aa  208  7e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  37.83 
 
 		 350 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  39.33 
 
 		 331 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  40.37 
 
 		 374 aa  203  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  36.59 
 
 		 337 aa  176  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  33.7 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  32.01 
 
 		 359 aa  169  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  31.68 
 
 		 359 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.44 
 
 		 484 aa  90.9  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 368 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  24.05 
 
 		 341 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  27.46 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.75 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 365 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  26.18 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.63 
 
 		 470 aa  77.4  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.32 
 
 		 472 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  22.48 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.8 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.4 
 
 		 473 aa  73.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  22.78 
 
 		 341 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.96 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  22.05 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.12 
 
 		 490 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.07 
 
 		 469 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  25.11 
 
 		 475 aa  71.6  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.84 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.64 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  24.12 
 
 		 350 aa  69.3  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.97 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.92 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.51 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  23.92 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2557  biotin synthase  26.02 
 
 		 369 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000730416  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.27 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  27.6 
 
 		 329 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0630  biotin synthase  26.07 
 
 		 350 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000166613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0923  biotin synthase  25.93 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0506953  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00742  biotin synthase  26.17 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000391904  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2867  biotin synthase  26.17 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0449634  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0828  biotin synthase  26.17 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000258207  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01807  biotin synthase  24.7 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0838  biotin synthase  26.17 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000158311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0798  biotin synthase  26.17 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000218975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.4 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2868  biotin synthase  26.17 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0428479  normal  0.0299932 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00759  hypothetical protein  26.17 
 
 		 346 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00062155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003871  biotin synthase  24.7 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.41 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.38 
 
 		 492 aa  63.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2577  biotin synthase  26.17 
 
 		 346 aa  63.2  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000942413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.21 
 
 		 467 aa  62.8  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  25 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  25.4 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  27.76 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  27.76 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  26.69 
 
 		 352 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.13 
 
 		 370 aa  62  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  25.98 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  26.18 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0858  biotin synthase  26.4 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.353933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0944  biotin synthase  26.4 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.921824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1425  biotin synthase  26.69 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  25.3 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  26.69 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0921  biotin synthase  26.4 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0830  biotin synthase  26.4 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0366287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1877  biotin synthase  26.09 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000328257  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0889  biotin synthase  26.4 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2931  biotin synthase  26.69 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>