262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1839 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  100 
 
 		 353 aa  730    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  67.74 
 
 		 372 aa  503  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  68.12 
 
 		 345 aa  498  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  63.09 
 
 		 347 aa  432  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  58.82 
 
 		 351 aa  420  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  56.56 
 
 		 374 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  45.64 
 
 		 351 aa  322  4e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  46.63 
 
 		 345 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  47.8 
 
 		 347 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  46.97 
 
 		 347 aa  311  7.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  43.64 
 
 		 354 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  45.21 
 
 		 350 aa  296  4e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  46.04 
 
 		 350 aa  295  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  46.76 
 
 		 349 aa  293  4e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  45.31 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  43.87 
 
 		 349 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  46.79 
 
 		 348 aa  281  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  48.87 
 
 		 348 aa  278  8e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  45.48 
 
 		 360 aa  272  8.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  44.34 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  41.69 
 
 		 348 aa  264  2e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  41.95 
 
 		 364 aa  260  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  41.4 
 
 		 352 aa  260  3e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  42.32 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  45.94 
 
 		 370 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  42.49 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 		 346 aa  248  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  40.81 
 
 		 356 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  47.41 
 
 		 311 aa  247  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  38.95 
 
 		 357 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  40.06 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  38.59 
 
 		 380 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  42.03 
 
 		 331 aa  232  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  37.05 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  36.94 
 
 		 359 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  36.63 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  37.66 
 
 		 337 aa  222  7e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  37.25 
 
 		 360 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  31.7 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  29.87 
 
 		 350 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  29.38 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 365 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.3 
 
 		 473 aa  89.7  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.95 
 
 		 473 aa  88.6  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.27 
 
 		 473 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.14 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.55 
 
 		 471 aa  84  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.9 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.19 
 
 		 470 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  23.62 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.15 
 
 		 471 aa  80.1  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  26.13 
 
 		 475 aa  79.7  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.93 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.31 
 
 		 484 aa  77  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.39 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.88 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.44 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.78 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.36 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.37 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  25 
 
 		 489 aa  73.2  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.12 
 
 		 479 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.12 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.49 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.43 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  27.12 
 
 		 331 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.27 
 
 		 492 aa  69.3  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.59 
 
 		 469 aa  68.9  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.78 
 
 		 479 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  27.38 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  27.38 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.12 
 
 		 367 aa  67  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  27.38 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  27.38 
 
 		 331 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.3 
 
 		 467 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  27.11 
 
 		 472 aa  66.2  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2451  biotin synthase  24.06 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2347  biotin synthase  24.92 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2499  biotin synthase  24.06 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.01 
 
 		 385 aa  65.9  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.77 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.09 
 
 		 465 aa  63.2  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.59 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.88 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  23.21 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  23.61 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  26.45 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  23.29 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  24.72 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.31 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  24.1 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  26.05 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  24.57 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.29 
 
 		 490 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  23.89 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  24.74 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  26.4 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  22.95 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  24.13 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2409  biotin synthase  24.09 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>