223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1844 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  100 
 
 		 360 aa  723    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  59.76 
 
 		 348 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  59.88 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  56.8 
 
 		 337 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  54.76 
 
 		 356 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  49.07 
 
 		 351 aa  311  1e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  45.95 
 
 		 347 aa  285  7e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  45.95 
 
 		 347 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  43.37 
 
 		 345 aa  280  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  46.65 
 
 		 349 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  44.21 
 
 		 349 aa  268  7e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  47.06 
 
 		 350 aa  265  7e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  44.71 
 
 		 344 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  45.68 
 
 		 354 aa  264  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  42.9 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  45.75 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  39.94 
 
 		 364 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  41.54 
 
 		 341 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  46.23 
 
 		 323 aa  252  7e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  40.62 
 
 		 346 aa  251  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  42.28 
 
 		 350 aa  250  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  44.75 
 
 		 348 aa  246  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  42.51 
 
 		 348 aa  242  6e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  42.53 
 
 		 359 aa  239  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  44.19 
 
 		 370 aa  239  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  44.48 
 
 		 352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  41.56 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  38.35 
 
 		 372 aa  231  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  45.14 
 
 		 331 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  40.07 
 
 		 359 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  37.87 
 
 		 380 aa  223  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  41.94 
 
 		 311 aa  222  7e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  40.49 
 
 		 347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  41.67 
 
 		 337 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  37.25 
 
 		 353 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  32.84 
 
 		 345 aa  193  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  39.54 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  34.83 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  28.53 
 
 		 350 aa  99.4  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 368 aa  98.2  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 		 365 aa  89.4  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  25.39 
 
 		 341 aa  86.3  8e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  26.74 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  28.86 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  24.61 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  25 
 
 		 341 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  25.48 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  24.15 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  31.93 
 
 		 344 aa  73.2  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.81 
 
 		 379 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.67 
 
 		 484 aa  69.3  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.9 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.57 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.77 
 
 		 469 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  25.35 
 
 		 475 aa  67  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.55 
 
 		 489 aa  66.2  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.76 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.57 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.41 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.82 
 
 		 471 aa  64.3  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.22 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.76 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2854  biotin synthase  30.92 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.4 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.77 
 
 		 481 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.14 
 
 		 463 aa  62.8  0.000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.69 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0664  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.5 
 
 		 355 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.428424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.32 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.98 
 
 		 473 aa  61.2  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.19 
 
 		 490 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  30.22 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.79 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  27.13 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.81 
 
 		 470 aa  59.7  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.34 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.74 
 
 		 458 aa  58.9  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  26.38 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.09 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  24.62 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.22 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.76 
 
 		 473 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.32 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2103  biotin synthase  27.62 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.881041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  24.19 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.43 
 
 		 469 aa  56.6  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1899  radical SAM family protein  25.5 
 
 		 591 aa  56.2  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.61 
 
 		 471 aa  56.2  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  27.31 
 
 		 368 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  26.05 
 
 		 364 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.97 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  27.62 
 
 		 369 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  24.55 
 
 		 349 aa  55.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.63 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1868  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.81 
 
 		 384 aa  54.3  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.386281  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3468  radical SAM family protein  24.5 
 
 		 592 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.453671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  25.5 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  24.84 
 
 		 366 aa  53.9  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  25.94 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1278  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.7 
 
 		 384 aa  53.9  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.173544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>