198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1241 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  70.35 
 
 
491 aa  754    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 
492 aa  1014    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  56.93 
 
 
473 aa  565  1e-160  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  56.29 
 
 
471 aa  561  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.67 
 
 
487 aa  545  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.8 
 
 
471 aa  535  1e-151  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.08 
 
 
471 aa  535  1e-151  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.58 
 
 
469 aa  538  1e-151  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.13 
 
 
474 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  56.52 
 
 
473 aa  508  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.88 
 
 
469 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.18 
 
 
479 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.29 
 
 
479 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.84 
 
 
481 aa  497  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.13 
 
 
466 aa  498  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.51 
 
 
490 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.97 
 
 
479 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.53 
 
 
464 aa  481  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  49.59 
 
 
472 aa  483  1e-135  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.59 
 
 
489 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.68 
 
 
469 aa  475  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  50 
 
 
467 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.8 
 
 
458 aa  473  1e-132  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.54 
 
 
477 aa  456  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.18 
 
 
473 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.39 
 
 
473 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  50.54 
 
 
475 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.53 
 
 
468 aa  441  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.29 
 
 
467 aa  433  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.85 
 
 
458 aa  424  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.71 
 
 
465 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  45.62 
 
 
474 aa  415  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.4 
 
 
472 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.06 
 
 
470 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.83 
 
 
484 aa  385  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.97 
 
 
472 aa  383  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.73 
 
 
463 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.4 
 
 
370 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.4 
 
 
374 aa  193  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.2 
 
 
356 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.21 
 
 
367 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.24 
 
 
376 aa  178  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.01 
 
 
367 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.73 
 
 
372 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.83 
 
 
371 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2462  thiazole biosynthesis protein ThiH  34.84 
 
 
372 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.55 
 
 
371 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.74 
 
 
370 aa  174  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.77 
 
 
366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.35 
 
 
369 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.55 
 
 
371 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.16 
 
 
371 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.77 
 
 
369 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.83 
 
 
371 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0664  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.53 
 
 
355 aa  171  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.428424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.52 
 
 
366 aa  171  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.33 
 
 
367 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.13 
 
 
370 aa  170  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3857  thiamine biosynthesis protein ThiH  31 
 
 
376 aa  170  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0342  thiamine biosynthesis protein ThiH  31 
 
 
376 aa  170  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.6 
 
 
381 aa  169  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1566  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.93 
 
 
363 aa  169  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0773107 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.6 
 
 
381 aa  169  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.23 
 
 
381 aa  169  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.31 
 
 
375 aa  168  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.33 
 
 
369 aa  168  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.66 
 
 
371 aa  168  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1557  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.24 
 
 
356 aa  168  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.190528  normal  0.123415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.02 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.68 
 
 
368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.88 
 
 
369 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2388  thiazole biosynthesis protein ThiH  28.61 
 
 
390 aa  167  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.63 
 
 
354 aa  167  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.05 
 
 
378 aa  167  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.2 
 
 
378 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.41 
 
 
371 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1855  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.02 
 
 
371 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.09 
 
 
378 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2587  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.89 
 
 
369 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.914294  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.36 
 
 
371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002077  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.42 
 
 
370 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  33.14 
 
 
369 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.57 
 
 
377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.57 
 
 
377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.1 
 
 
372 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5457  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.57 
 
 
377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0848103 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.98 
 
 
414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.57 
 
 
377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00361  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.69 
 
 
375 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4480  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.88 
 
 
377 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03866  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.88 
 
 
377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.09 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.12 
 
 
370 aa  164  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4223  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.88 
 
 
377 aa  164  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.57 
 
 
377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  32.36 
 
 
371 aa  163  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4489  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.89 
 
 
377 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  28.69 
 
 
383 aa  163  7e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4437  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.57 
 
 
377 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.2 
 
 
377 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>