166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1886 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  92.7 
 
 		 375 aa  721    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 		 371 aa  768    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  98.38 
 
 		 371 aa  759    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  97.57 
 
 		 371 aa  753    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  83.56 
 
 		 371 aa  657    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  83.47 
 
 		 371 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  83.02 
 
 		 371 aa  655    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  83.56 
 
 		 371 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  83.83 
 
 		 371 aa  661    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  74.18 
 
 		 369 aa  592  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  76.15 
 
 		 371 aa  593  1e-168  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  72.83 
 
 		 368 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  73.78 
 
 		 372 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2587  thiamine biosynthesis protein ThiH  75.07 
 
 		 369 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.914294  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2018  thiamine biosynthesis protein ThiH  74.25 
 
 		 374 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.705115 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1855  thiamine biosynthesis protein ThiH  71.58 
 
 		 371 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002077  thiazole biosynthesis protein ThiH  60.33 
 
 		 370 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2988  thiamine biosynthesis protein ThiH  59.78 
 
 		 370 aa  488  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00361  thiamine biosynthesis protein ThiH  59.52 
 
 		 375 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  59.24 
 
 		 370 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  54.37 
 
 		 377 aa  431  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5457  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.64 
 
 		 377 aa  431  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0848103 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.37 
 
 		 377 aa  431  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03866  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.1 
 
 		 377 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03819  hypothetical protein  53.83 
 
 		 377 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4223  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.1 
 
 		 377 aa  429  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.37 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4437  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.37 
 
 		 377 aa  427  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208104 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4480  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.83 
 
 		 377 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3857  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.34 
 
 		 376 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3720  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.52 
 
 		 377 aa  425  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.526508  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0342  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.34 
 
 		 376 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4489  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.97 
 
 		 377 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4369  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.97 
 
 		 377 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4402  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.7 
 
 		 377 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.79 
 
 		 381 aa  419  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.7 
 
 		 377 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4565  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.7 
 
 		 377 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2462  thiazole biosynthesis protein ThiH  51.49 
 
 		 372 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0202  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.78 
 
 		 377 aa  420  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0365  thiazole biosynthesis protein ThiH  52.17 
 
 		 372 aa  417  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  52.19 
 
 		 369 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.68 
 
 		 377 aa  410  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2388  thiazole biosynthesis protein ThiH  55.52 
 
 		 390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.65 
 
 		 378 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.19 
 
 		 373 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  48.77 
 
 		 383 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  51.35 
 
 		 372 aa  401  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0215  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.91 
 
 		 373 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0046  thiH protein  49.32 
 
 		 382 aa  390  1e-107  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.081488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  50.27 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  47.48 
 
 		 378 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.97 
 
 		 370 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.57 
 
 		 370 aa  359  4e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.15 
 
 		 374 aa  359  5e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.8 
 
 		 378 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  42.47 
 
 		 370 aa  315  9e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.1 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  42.62 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  41.92 
 
 		 368 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.29 
 
 		 367 aa  296  3e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.01 
 
 		 367 aa  292  8e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  39.45 
 
 		 367 aa  290  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1137  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.93 
 
 		 430 aa  288  8e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.867554  normal  0.132743 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.4 
 
 		 414 aa  285  9e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3075  thiamine biosynthesis protein ThiH  42.49 
 
 		 388 aa  285  9e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  42.73 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.97 
 
 		 389 aa  282  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  40.98 
 
 		 369 aa  280  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.99 
 
 		 377 aa  272  6e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0728  thiazole biosynthesis protein ThiH  41.8 
 
 		 372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00541403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0664  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.37 
 
 		 355 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.428424  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1566  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.71 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0773107 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1868  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.29 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.386281  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.53 
 
 		 381 aa  263  4e-69  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.24 
 
 		 381 aa  261  1e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.24 
 
 		 381 aa  259  4e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  38.5 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.09 
 
 		 366 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.66 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.77 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.76 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1278  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.39 
 
 		 384 aa  255  7e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.173544  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.88 
 
 		 369 aa  251  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1557  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.54 
 
 		 356 aa  247  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.190528  normal  0.123415 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  39.88 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1837  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.89 
 
 		 388 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151757  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3488  thiazole biosynthesis protein ThiH  55.96 
 
 		 209 aa  235  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32068  normal  0.0691768 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.1 
 
 		 369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.79 
 
 		 458 aa  210  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.06 
 
 		 385 aa  209  9e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.01 
 
 		 464 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.15 
 
 		 467 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1746  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.37 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0157605  normal  0.01356 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.86 
 
 		 458 aa  203  4e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.78 
 
 		 465 aa  195  1e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0450  thiazole biosynthesis protein ThiH  53.71 
 
 		 196 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000180873 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.62 
 
 		 469 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.34 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.95 
 
 		 481 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>