160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1868 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1868  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 
384 aa  794    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.386281  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1278  thiamine biosynthesis protein ThiH  80.47 
 
 
384 aa  653    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.173544  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  69.66 
 
 
379 aa  555  1e-157  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  66.06 
 
 
386 aa  529  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  61.38 
 
 
381 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  61.38 
 
 
381 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  60.58 
 
 
381 aa  488  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  59.31 
 
 
377 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1746  thiamine biosynthesis protein ThiH  56.76 
 
 
413 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0157605  normal  0.01356 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.59 
 
 
385 aa  351  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1137  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.56 
 
 
430 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.867554  normal  0.132743 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.33 
 
 
414 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  44.85 
 
 
369 aa  306  6e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  42.94 
 
 
370 aa  299  5e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  42.4 
 
 
367 aa  294  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.27 
 
 
376 aa  292  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  43.19 
 
 
368 aa  292  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.99 
 
 
389 aa  288  8e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.81 
 
 
367 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  44.04 
 
 
366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  40.7 
 
 
369 aa  282  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.35 
 
 
369 aa  278  1e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  40.71 
 
 
374 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2462  thiazole biosynthesis protein ThiH  40.99 
 
 
372 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002077  thiazole biosynthesis protein ThiH  38.37 
 
 
370 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0365  thiazole biosynthesis protein ThiH  40.18 
 
 
372 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.11 
 
 
378 aa  272  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  39.31 
 
 
372 aa  270  2e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0728  thiazole biosynthesis protein ThiH  40.72 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00541403  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  38.02 
 
 
383 aa  270  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00361  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.33 
 
 
375 aa  269  7e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.1 
 
 
370 aa  267  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  39.36 
 
 
371 aa  266  5.999999999999999e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  38.15 
 
 
367 aa  265  7e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.29 
 
 
371 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.23 
 
 
371 aa  264  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.29 
 
 
371 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2018  thiamine biosynthesis protein ThiH  40 
 
 
374 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.705115 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.71 
 
 
371 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.08 
 
 
371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  37.82 
 
 
378 aa  259  6e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.91 
 
 
372 aa  259  7e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.37 
 
 
371 aa  259  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.42 
 
 
375 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2988  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.63 
 
 
370 aa  258  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.67 
 
 
370 aa  258  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.08 
 
 
371 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.55 
 
 
377 aa  255  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.03 
 
 
374 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.79 
 
 
371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1855  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.6 
 
 
371 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4369  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.26 
 
 
377 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.19 
 
 
368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  38.26 
 
 
377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.26 
 
 
377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.84 
 
 
373 aa  253  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.5 
 
 
371 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.26 
 
 
377 aa  253  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4489  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.26 
 
 
377 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456857 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5457  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.26 
 
 
377 aa  252  7e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0848103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03866  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.26 
 
 
377 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4480  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.26 
 
 
377 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0215  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.55 
 
 
373 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4223  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.26 
 
 
377 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4565  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.68 
 
 
377 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.86 
 
 
377 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03819  hypothetical protein  37.97 
 
 
377 aa  249  7e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0202  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.97 
 
 
377 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3857  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.72 
 
 
376 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0342  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.72 
 
 
376 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4437  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.97 
 
 
377 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4402  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.1 
 
 
377 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0046  thiH protein  37.03 
 
 
382 aa  247  3e-64  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.081488  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3720  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.1 
 
 
377 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.526508  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.16 
 
 
369 aa  244  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.97 
 
 
381 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.2 
 
 
369 aa  243  5e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2587  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.83 
 
 
369 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.914294  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.17 
 
 
370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.95 
 
 
378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2388  thiazole biosynthesis protein ThiH  37.03 
 
 
390 aa  232  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.81 
 
 
356 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1566  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.96 
 
 
363 aa  218  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0773107 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0664  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.64 
 
 
355 aa  208  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.428424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.67 
 
 
366 aa  206  5e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3075  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.43 
 
 
388 aa  203  5e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  32.61 
 
 
378 aa  203  5e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1557  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.91 
 
 
356 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.190528  normal  0.123415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.29 
 
 
354 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.66 
 
 
458 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.83 
 
 
468 aa  176  8e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.54 
 
 
466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1837  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.33 
 
 
388 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151757  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.73 
 
 
481 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.49 
 
 
469 aa  170  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.08 
 
 
477 aa  168  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.57 
 
 
471 aa  166  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.57 
 
 
473 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.15 
 
 
489 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.43 
 
 
464 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>