157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0365 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0365  thiazole biosynthesis protein ThiH  100 
 
 
372 aa  777    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2988  thiamine biosynthesis protein ThiH  65.5 
 
 
370 aa  531  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002077  thiazole biosynthesis protein ThiH  64.42 
 
 
370 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00361  thiamine biosynthesis protein ThiH  63.56 
 
 
375 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  62.53 
 
 
370 aa  496  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  63.01 
 
 
369 aa  491  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2462  thiazole biosynthesis protein ThiH  60.7 
 
 
372 aa  483  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  60.55 
 
 
377 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  60.11 
 
 
372 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3720  thiamine biosynthesis protein ThiH  58.2 
 
 
377 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.526508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  61.71 
 
 
371 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4565  thiamine biosynthesis protein ThiH  58.27 
 
 
377 aa  461  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.72 
 
 
377 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4489  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.72 
 
 
377 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456857 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.45 
 
 
377 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03866  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.18 
 
 
377 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5457  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.18 
 
 
377 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0848103 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  58.2 
 
 
378 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0215  thiamine biosynthesis protein ThiH  58.58 
 
 
373 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03819  hypothetical protein  56.91 
 
 
377 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3857  thiamine biosynthesis protein ThiH  58.42 
 
 
376 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4223  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.18 
 
 
377 aa  455  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4369  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.45 
 
 
377 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0342  thiamine biosynthesis protein ThiH  58.42 
 
 
376 aa  457  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  57.18 
 
 
377 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4480  thiamine biosynthesis protein ThiH  56.91 
 
 
377 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.18 
 
 
377 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.65 
 
 
381 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4437  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.18 
 
 
377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4402  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.18 
 
 
377 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  58.04 
 
 
373 aa  451  1e-125  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  55.26 
 
 
383 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2388  thiazole biosynthesis protein ThiH  57.61 
 
 
390 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0202  thiamine biosynthesis protein ThiH  56.91 
 
 
377 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.92 
 
 
368 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.19 
 
 
369 aa  427  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.9 
 
 
371 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.17 
 
 
371 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.17 
 
 
371 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.15 
 
 
371 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.42 
 
 
371 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.09 
 
 
375 aa  411  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.64 
 
 
371 aa  411  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.81 
 
 
371 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.15 
 
 
371 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.67 
 
 
372 aa  411  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.88 
 
 
371 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2018  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.72 
 
 
374 aa  412  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.705115 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.54 
 
 
378 aa  408  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1855  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.95 
 
 
371 aa  410  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.36 
 
 
370 aa  402  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2587  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.63 
 
 
369 aa  401  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.914294  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0046  thiH protein  51.37 
 
 
382 aa  392  1e-108  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.081488  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.36 
 
 
378 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.95 
 
 
370 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.7 
 
 
374 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.01 
 
 
376 aa  329  5.0000000000000004e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.57 
 
 
370 aa  325  9e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  43.01 
 
 
368 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  41.64 
 
 
366 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.92 
 
 
414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  40 
 
 
367 aa  305  8.000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1137  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.42 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.867554  normal  0.132743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.5 
 
 
389 aa  302  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  40.6 
 
 
369 aa  297  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.45 
 
 
367 aa  295  9e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3075  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.62 
 
 
388 aa  291  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  39.89 
 
 
367 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  42.7 
 
 
377 aa  280  2e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.4 
 
 
381 aa  276  5e-73  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1278  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.7 
 
 
384 aa  275  7e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.173544  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.11 
 
 
386 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.57 
 
 
379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.11 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.4 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1868  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.18 
 
 
384 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.386281  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.12 
 
 
356 aa  270  4e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  38.03 
 
 
378 aa  267  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  39.54 
 
 
374 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0728  thiazole biosynthesis protein ThiH  41.26 
 
 
372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00541403  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0664  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.21 
 
 
355 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.428424  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3488  thiazole biosynthesis protein ThiH  60.2 
 
 
209 aa  258  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32068  normal  0.0691768 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1557  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.24 
 
 
356 aa  250  3e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.190528  normal  0.123415 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.53 
 
 
369 aa  249  7e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1837  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.88 
 
 
388 aa  248  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151757  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1566  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.45 
 
 
363 aa  246  6e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0773107 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.46 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.02 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.73 
 
 
385 aa  242  7.999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1746  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.37 
 
 
413 aa  236  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0157605  normal  0.01356 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.48 
 
 
369 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.23 
 
 
464 aa  203  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.18 
 
 
458 aa  203  4e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0450  thiazole biosynthesis protein ThiH  55.75 
 
 
196 aa  203  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000180873 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.13 
 
 
467 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.53 
 
 
458 aa  188  2e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.2 
 
 
481 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.39 
 
 
469 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.53 
 
 
477 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.21 
 
 
466 aa  177  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>