128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A3488 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3488  thiazole biosynthesis protein ThiH  100 
 
 		 209 aa  440  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32068  normal  0.0691768 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3857  thiamine biosynthesis protein ThiH  95.26 
 
 		 376 aa  423  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0342  thiamine biosynthesis protein ThiH  95.26 
 
 		 376 aa  423  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  89.95 
 
 		 377 aa  380  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  85.07 
 
 		 381 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0215  thiamine biosynthesis protein ThiH  83.08 
 
 		 373 aa  367  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  81.25 
 
 		 373 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5457  thiamine biosynthesis protein ThiH  80.81 
 
 		 377 aa  348  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0848103 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  80.3 
 
 		 377 aa  347  5e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4223  thiamine biosynthesis protein ThiH  80.3 
 
 		 377 aa  347  6e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4480  thiamine biosynthesis protein ThiH  80.3 
 
 		 377 aa  347  6e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03866  thiamine biosynthesis protein ThiH  80.71 
 
 		 377 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03819  hypothetical protein  80.71 
 
 		 377 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4369  thiamine biosynthesis protein ThiH  78.22 
 
 		 377 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4489  thiamine biosynthesis protein ThiH  77.72 
 
 		 377 aa  345  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456857 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  79.8 
 
 		 377 aa  344  6e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  79.8 
 
 		 377 aa  344  6e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4437  thiamine biosynthesis protein ThiH  79.8 
 
 		 377 aa  344  6e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208104 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  77.23 
 
 		 377 aa  343  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4565  thiamine biosynthesis protein ThiH  77.23 
 
 		 377 aa  343  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453457 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4402  thiamine biosynthesis protein ThiH  77.72 
 
 		 377 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3720  thiamine biosynthesis protein ThiH  78.33 
 
 		 377 aa  342  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.526508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0202  thiamine biosynthesis protein ThiH  79.21 
 
 		 377 aa  337  9e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0046  thiH protein  67.18 
 
 		 382 aa  290  8e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.081488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2988  thiamine biosynthesis protein ThiH  66.33 
 
 		 370 aa  285  4e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002077  thiazole biosynthesis protein ThiH  64.47 
 
 		 370 aa  278  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00361  thiamine biosynthesis protein ThiH  63.37 
 
 		 375 aa  273  1.0000000000000001e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  66.49 
 
 		 370 aa  271  4.0000000000000004e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0365  thiazole biosynthesis protein ThiH  60.2 
 
 		 372 aa  258  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  62.5 
 
 		 369 aa  255  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  56.48 
 
 		 368 aa  250  9.000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  59.49 
 
 		 372 aa  248  5e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2462  thiazole biosynthesis protein ThiH  58.97 
 
 		 372 aa  248  6e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.15 
 
 		 371 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.15 
 
 		 371 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.29 
 
 		 371 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  54.55 
 
 		 383 aa  242  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.92 
 
 		 371 aa  241  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.66 
 
 		 371 aa  240  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.17 
 
 		 371 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2018  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.92 
 
 		 374 aa  238  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.705115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  54.46 
 
 		 371 aa  238  5.999999999999999e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1855  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.27 
 
 		 371 aa  237  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.5 
 
 		 369 aa  237  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.96 
 
 		 371 aa  235  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.44 
 
 		 371 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.45 
 
 		 372 aa  235  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.44 
 
 		 375 aa  234  9e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.44 
 
 		 371 aa  234  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  56.16 
 
 		 378 aa  232  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2388  thiazole biosynthesis protein ThiH  55.61 
 
 		 390 aa  230  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.67 
 
 		 370 aa  229  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2587  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.37 
 
 		 369 aa  229  3e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.914294  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.37 
 
 		 378 aa  223  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  50 
 
 		 374 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.96 
 
 		 370 aa  199  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.26 
 
 		 378 aa  190  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3075  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.26 
 
 		 388 aa  187  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.88 
 
 		 376 aa  171  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0664  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.04 
 
 		 355 aa  165  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.428424  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  42.16 
 
 		 414 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.62 
 
 		 389 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1557  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.28 
 
 		 356 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.190528  normal  0.123415 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.15 
 
 		 370 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.01 
 
 		 354 aa  157  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  40.84 
 
 		 368 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  37.77 
 
 		 378 aa  155  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  42.05 
 
 		 356 aa  155  4e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.89 
 
 		 367 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1566  thiamine biosynthesis protein ThiH  42.49 
 
 		 363 aa  151  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0773107 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0728  thiazole biosynthesis protein ThiH  42.86 
 
 		 372 aa  152  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00541403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.37 
 
 		 367 aa  149  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1837  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.68 
 
 		 388 aa  149  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151757  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  42.05 
 
 		 366 aa  149  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  38.54 
 
 		 367 aa  144  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.41 
 
 		 386 aa  142  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  38.34 
 
 		 366 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.5 
 
 		 379 aa  142  5e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1137  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.1 
 
 		 430 aa  141  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.867554  normal  0.132743 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1278  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.13 
 
 		 384 aa  139  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.173544  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.75 
 
 		 377 aa  139  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.37 
 
 		 369 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1746  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.3 
 
 		 413 aa  137  7.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0157605  normal  0.01356 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  35.38 
 
 		 369 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1868  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.13 
 
 		 384 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.386281  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.95 
 
 		 381 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  37.06 
 
 		 374 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.95 
 
 		 381 aa  132  3e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.95 
 
 		 381 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.68 
 
 		 469 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.36 
 
 		 458 aa  132  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.87 
 
 		 467 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.38 
 
 		 481 aa  128  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.27 
 
 		 385 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.85 
 
 		 369 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.85 
 
 		 490 aa  124  8.000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.35 
 
 		 464 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.87 
 
 		 473 aa  121  8e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  34.67 
 
 		 472 aa  121  8e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.87 
 
 		 471 aa  121  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>