190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1504 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  66.31 
 
 		 471 aa  651    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  97.66 
 
 		 471 aa  952    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 		 473 aa  971    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  72.82 
 
 		 471 aa  729    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  75.8 
 
 		 469 aa  745    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  56.93 
 
 		 492 aa  565  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.86 
 
 		 474 aa  558  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  58.46 
 
 		 487 aa  558  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  58.39 
 
 		 473 aa  554  1e-156  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  54.47 
 
 		 472 aa  540  9.999999999999999e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.67 
 
 		 491 aa  528  1e-149  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.45 
 
 		 469 aa  520  1e-146  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.3 
 
 		 469 aa  518  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.54 
 
 		 481 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.65 
 
 		 466 aa  501  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.7 
 
 		 490 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.05 
 
 		 489 aa  495  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.29 
 
 		 477 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  50.94 
 
 		 475 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.13 
 
 		 467 aa  481  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.67 
 
 		 479 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.24 
 
 		 479 aa  478  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.24 
 
 		 479 aa  480  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.56 
 
 		 464 aa  479  1e-134  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.47 
 
 		 473 aa  474  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.26 
 
 		 472 aa  467  9.999999999999999e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.83 
 
 		 473 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.75 
 
 		 458 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.46 
 
 		 468 aa  461  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.73 
 
 		 467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  47.49 
 
 		 474 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.25 
 
 		 458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.29 
 
 		 465 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.53 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.9 
 
 		 484 aa  422  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.57 
 
 		 470 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.11 
 
 		 463 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.2 
 
 		 370 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.05 
 
 		 374 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.3 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.79 
 
 		 376 aa  204  3e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2388  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.36 
 
 		 390 aa  204  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.23 
 
 		 414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.29 
 
 		 386 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.59 
 
 		 378 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  32.58 
 
 		 378 aa  193  6e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.61 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0342  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.64 
 
 		 376 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.83 
 
 		 372 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3857  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.64 
 
 		 376 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.27 
 
 		 385 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.61 
 
 		 369 aa  188  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4489  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.36 
 
 		 377 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.37 
 
 		 381 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.06 
 
 		 371 aa  187  3e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.07 
 
 		 378 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.09 
 
 		 377 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.4 
 
 		 379 aa  186  6e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.75 
 
 		 371 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.59 
 
 		 381 aa  186  7e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4369  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.09 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.51 
 
 		 356 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.75 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.43 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4402  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.53 
 
 		 377 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.75 
 
 		 371 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.1 
 
 		 368 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4565  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.81 
 
 		 377 aa  184  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453457 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.64 
 
 		 367 aa  183  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.17 
 
 		 369 aa  183  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.8 
 
 		 377 aa  183  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.02 
 
 		 381 aa  182  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.02 
 
 		 381 aa  182  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5457  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.23 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0848103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.94 
 
 		 370 aa  182  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.23 
 
 		 377 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  29.23 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.23 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.43 
 
 		 371 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.91 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03866  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.94 
 
 		 377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.37 
 
 		 375 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4480  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.94 
 
 		 377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.36 
 
 		 367 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4223  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.94 
 
 		 377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.55 
 
 		 371 aa  180  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00361  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.45 
 
 		 375 aa  181  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.25 
 
 		 371 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  29.63 
 
 		 383 aa  180  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  28.69 
 
 		 367 aa  179  5.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1855  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.21 
 
 		 371 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.62 
 
 		 369 aa  180  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4437  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.23 
 
 		 377 aa  179  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208104 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002077  thiazole biosynthesis protein ThiH  28.53 
 
 		 370 aa  179  7e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.77 
 
 		 370 aa  179  8e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3720  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.73 
 
 		 377 aa  179  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.526508  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1557  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.09 
 
 		 356 aa  179  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.190528  normal  0.123415 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2988  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.68 
 
 		 370 aa  179  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.89 
 
 		 373 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.74 
 
 		 368 aa  178  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>