194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0163 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 		 491 aa  1016    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  70.35 
 
 		 492 aa  754    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.96 
 
 		 487 aa  548  1e-154  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.51 
 
 		 471 aa  532  1e-150  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.17 
 
 		 471 aa  534  1e-150  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.67 
 
 		 473 aa  528  1e-149  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.06 
 
 		 471 aa  522  1e-147  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.99 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.78 
 
 		 469 aa  512  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.89 
 
 		 474 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.22 
 
 		 481 aa  501  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.08 
 
 		 466 aa  495  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.88 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.53 
 
 		 479 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.75 
 
 		 479 aa  487  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.21 
 
 		 479 aa  485  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.83 
 
 		 473 aa  482  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  49.14 
 
 		 472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.61 
 
 		 469 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.44 
 
 		 490 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  50 
 
 		 467 aa  463  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.48 
 
 		 489 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  50 
 
 		 458 aa  448  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.53 
 
 		 477 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.91 
 
 		 467 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.79 
 
 		 473 aa  438  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.58 
 
 		 473 aa  438  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.21 
 
 		 468 aa  436  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.97 
 
 		 458 aa  432  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  50.98 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  48.28 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.04 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.03 
 
 		 470 aa  393  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.84 
 
 		 472 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.44 
 
 		 484 aa  388  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.01 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.11 
 
 		 463 aa  278  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.19 
 
 		 370 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.7 
 
 		 374 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  35 
 
 		 370 aa  175  9.999999999999999e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.94 
 
 		 366 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.83 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.96 
 
 		 375 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.33 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.83 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.33 
 
 		 376 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.44 
 
 		 383 aa  170  4e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.5 
 
 		 367 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.24 
 
 		 377 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0342  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.93 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3857  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.93 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.07 
 
 		 381 aa  169  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.42 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.65 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.42 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.69 
 
 		 372 aa  168  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5457  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.65 
 
 		 377 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0848103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.12 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  34.06 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03866  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.06 
 
 		 377 aa  167  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.41 
 
 		 377 aa  167  4e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4489  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.52 
 
 		 377 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456857 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4480  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.28 
 
 		 377 aa  167  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.82 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4369  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.64 
 
 		 377 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.75 
 
 		 371 aa  167  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.59 
 
 		 369 aa  167  5e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4223  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.28 
 
 		 377 aa  167  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.38 
 
 		 371 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4402  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.42 
 
 		 377 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.98 
 
 		 354 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4437  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.42 
 
 		 377 aa  166  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208104 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.17 
 
 		 356 aa  166  9e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.06 
 
 		 371 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.75 
 
 		 371 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.75 
 
 		 371 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.38 
 
 		 371 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4565  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.42 
 
 		 377 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453457 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.78 
 
 		 373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.56 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.06 
 
 		 371 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.19 
 
 		 369 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.41 
 
 		 378 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2388  thiazole biosynthesis protein ThiH  28.8 
 
 		 390 aa  163  5.0000000000000005e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1855  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.79 
 
 		 371 aa  163  7e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0215  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.67 
 
 		 373 aa  163  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.65 
 
 		 371 aa  162  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03819  hypothetical protein  30.52 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.68 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.84 
 
 		 368 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0202  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.03 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.14 
 
 		 370 aa  160  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.44 
 
 		 381 aa  160  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.7 
 
 		 367 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.33 
 
 		 377 aa  160  7e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  33.51 
 
 		 374 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2587  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.43 
 
 		 369 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.914294  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0046  thiH protein  29.26 
 
 		 382 aa  157  3e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.081488  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0664  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.84 
 
 		 355 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.428424  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.82 
 
 		 378 aa  157  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>