174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2082 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  66.38 
 
 		 472 aa  659    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  64.76 
 
 		 474 aa  635    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 		 472 aa  980    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  65.49 
 
 		 484 aa  650    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  70.55 
 
 		 470 aa  673    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  56.25 
 
 		 475 aa  548  1e-155  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  56.84 
 
 		 466 aa  532  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.53 
 
 		 469 aa  531  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.37 
 
 		 473 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.16 
 
 		 473 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.5 
 
 		 477 aa  504  9.999999999999999e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.26 
 
 		 489 aa  502  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.21 
 
 		 467 aa  496  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.59 
 
 		 468 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.26 
 
 		 471 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.26 
 
 		 473 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.73 
 
 		 469 aa  437  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.5 
 
 		 490 aa  435  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.17 
 
 		 479 aa  427  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.74 
 
 		 479 aa  425  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.96 
 
 		 479 aa  426  1e-118  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.57 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.79 
 
 		 481 aa  428  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.93 
 
 		 471 aa  422  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.79 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.89 
 
 		 467 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  46.57 
 
 		 472 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.07 
 
 		 487 aa  409  1e-113  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.13 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.52 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.78 
 
 		 474 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.4 
 
 		 492 aa  399  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.84 
 
 		 491 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.79 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.94 
 
 		 473 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.13 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.9 
 
 		 463 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.19 
 
 		 369 aa  209  7e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.56 
 
 		 369 aa  206  9e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.46 
 
 		 367 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.22 
 
 		 367 aa  194  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.26 
 
 		 385 aa  193  5e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.71 
 
 		 370 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.08 
 
 		 356 aa  192  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.64 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  35.2 
 
 		 383 aa  192  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.03 
 
 		 354 aa  190  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.79 
 
 		 374 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1566  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.33 
 
 		 363 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0773107 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.14 
 
 		 376 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  34.34 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2462  thiazole biosynthesis protein ThiH  33.74 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.96 
 
 		 368 aa  186  9e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0664  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.53 
 
 		 355 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.428424  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.03 
 
 		 366 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1557  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.83 
 
 		 356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.190528  normal  0.123415 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  33.33 
 
 		 372 aa  183  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  33.55 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.19 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.05 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.5 
 
 		 369 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.07 
 
 		 370 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  33.12 
 
 		 367 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.7 
 
 		 371 aa  177  4e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1137  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.38 
 
 		 430 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.867554  normal  0.132743 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.46 
 
 		 379 aa  177  5e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.79 
 
 		 366 aa  176  8e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.03 
 
 		 389 aa  176  9e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.89 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002077  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.15 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2988  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.15 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.46 
 
 		 368 aa  172  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0728  thiazole biosynthesis protein ThiH  34.74 
 
 		 372 aa  171  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00541403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.89 
 
 		 381 aa  171  3e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.79 
 
 		 371 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2388  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.18 
 
 		 390 aa  170  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.89 
 
 		 381 aa  170  6e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.88 
 
 		 381 aa  170  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00361  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.65 
 
 		 375 aa  170  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.27 
 
 		 371 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.02 
 
 		 372 aa  169  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.56 
 
 		 378 aa  169  9e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.62 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1278  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.86 
 
 		 384 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.173544  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.27 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.94 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.6 
 
 		 370 aa  167  5e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0365  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.55 
 
 		 372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0342  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.28 
 
 		 376 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3857  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.28 
 
 		 376 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.22 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.33 
 
 		 378 aa  163  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0202  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.21 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.5 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3720  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.37 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.526508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.98 
 
 		 377 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.61 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.27 
 
 		 371 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  29 
 
 		 378 aa  160  5e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1855  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.91 
 
 		 371 aa  160  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>