176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4565 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03866  thiamine biosynthesis protein ThiH  88.8 
 
 		 377 aa  714    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  89.33 
 
 		 377 aa  716    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  80 
 
 		 381 aa  636    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4489  thiamine biosynthesis protein ThiH  94.69 
 
 		 377 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456857 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03819  hypothetical protein  88 
 
 		 377 aa  708    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4402  thiamine biosynthesis protein ThiH  94.69 
 
 		 377 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4480  thiamine biosynthesis protein ThiH  88.8 
 
 		 377 aa  715    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  89.33 
 
 		 377 aa  716    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  98.41 
 
 		 377 aa  780    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  80.22 
 
 		 373 aa  636    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0202  thiamine biosynthesis protein ThiH  86.47 
 
 		 377 aa  698    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4437  thiamine biosynthesis protein ThiH  89.33 
 
 		 377 aa  717    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000208104 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4369  thiamine biosynthesis protein ThiH  96.55 
 
 		 377 aa  764    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4223  thiamine biosynthesis protein ThiH  89.07 
 
 		 377 aa  717    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  89.6 
 
 		 377 aa  719    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5457  thiamine biosynthesis protein ThiH  89.33 
 
 		 377 aa  718    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0848103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4565  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 		 377 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000453457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3720  thiamine biosynthesis protein ThiH  78.98 
 
 		 377 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.526508  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3857  thiamine biosynthesis protein ThiH  78.11 
 
 		 376 aa  627  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0342  thiamine biosynthesis protein ThiH  78.11 
 
 		 376 aa  627  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0215  thiamine biosynthesis protein ThiH  78.86 
 
 		 373 aa  624  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  77.75 
 
 		 377 aa  627  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0046  thiH protein  63.11 
 
 		 382 aa  511  1e-144  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.081488  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2988  thiamine biosynthesis protein ThiH  63.84 
 
 		 370 aa  509  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  64.56 
 
 		 370 aa  495  1e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002077  thiazole biosynthesis protein ThiH  61.48 
 
 		 370 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00361  thiamine biosynthesis protein ThiH  60.38 
 
 		 375 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0365  thiazole biosynthesis protein ThiH  58.27 
 
 		 372 aa  461  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  56.95 
 
 		 369 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.92 
 
 		 368 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  59.38 
 
 		 378 aa  436  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2462  thiazole biosynthesis protein ThiH  54.08 
 
 		 372 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.73 
 
 		 369 aa  422  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1855  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.89 
 
 		 371 aa  423  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  52.32 
 
 		 383 aa  422  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.12 
 
 		 375 aa  418  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.7 
 
 		 371 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.43 
 
 		 371 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.88 
 
 		 371 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.29 
 
 		 371 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  53.23 
 
 		 372 aa  411  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.22 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.22 
 
 		 371 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.95 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.95 
 
 		 371 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.41 
 
 		 371 aa  404  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2018  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.28 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.705115 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.27 
 
 		 372 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  51.91 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2388  thiazole biosynthesis protein ThiH  52.45 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2587  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.37 
 
 		 369 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.914294  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.4 
 
 		 370 aa  385  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  50.68 
 
 		 378 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.45 
 
 		 370 aa  349  5e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.12 
 
 		 374 aa  345  8e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3488  thiazole biosynthesis protein ThiH  77.23 
 
 		 209 aa  343  4e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32068  normal  0.0691768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.09 
 
 		 378 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.25 
 
 		 376 aa  296  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0450  thiazole biosynthesis protein ThiH  77.59 
 
 		 196 aa  292  7e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000180873 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.79 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  42.86 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.93 
 
 		 389 aa  289  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  40.77 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  38.15 
 
 		 366 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.35 
 
 		 367 aa  280  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3075  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.36 
 
 		 388 aa  279  7e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.47 
 
 		 367 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1137  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.31 
 
 		 430 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.867554  normal  0.132743 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  40.17 
 
 		 378 aa  263  4e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  35.5 
 
 		 369 aa  262  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1278  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.26 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.173544  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.48 
 
 		 356 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0728  thiazole biosynthesis protein ThiH  42.66 
 
 		 372 aa  259  4e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00541403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  35.62 
 
 		 367 aa  257  2e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  40 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0664  thiamine biosynthesis protein ThiH  40 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.428424  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1868  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.68 
 
 		 384 aa  251  2e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.386281  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.08 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1566  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.71 
 
 		 363 aa  248  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0773107 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1557  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.51 
 
 		 356 aa  248  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.190528  normal  0.123415 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.64 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.22 
 
 		 386 aa  245  9e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.39 
 
 		 366 aa  242  7e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  37.1 
 
 		 374 aa  242  9e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.92 
 
 		 381 aa  238  9e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.63 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.34 
 
 		 381 aa  236  5.0000000000000005e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1837  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.44 
 
 		 388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151757  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.63 
 
 		 369 aa  227  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1746  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.71 
 
 		 413 aa  219  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0157605  normal  0.01356 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.06 
 
 		 385 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.57 
 
 		 369 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.13 
 
 		 469 aa  199  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.6 
 
 		 458 aa  199  9e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.86 
 
 		 464 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.33 
 
 		 481 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.43 
 
 		 467 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.33 
 
 		 479 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.83 
 
 		 479 aa  187  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.96 
 
 		 473 aa  186  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>