171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1188 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 
381 aa  786    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  99.48 
 
 
381 aa  782    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  96.85 
 
 
381 aa  763    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  77.72 
 
 
377 aa  618  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1868  thiamine biosynthesis protein ThiH  61.38 
 
 
384 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.386281  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1278  thiamine biosynthesis protein ThiH  61.21 
 
 
384 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.173544  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  61.84 
 
 
379 aa  490  1e-137  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  60.89 
 
 
386 aa  483  1e-135  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1746  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.97 
 
 
413 aa  427  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0157605  normal  0.01356 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.62 
 
 
385 aa  342  7e-93  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.11 
 
 
414 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.3 
 
 
389 aa  315  8e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1137  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.93 
 
 
430 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.867554  normal  0.132743 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.44 
 
 
376 aa  307  2.0000000000000002e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  44.35 
 
 
366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  44 
 
 
368 aa  299  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.82 
 
 
367 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  43.06 
 
 
369 aa  295  8e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.71 
 
 
370 aa  294  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  43.24 
 
 
367 aa  287  2e-76  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0365  thiazole biosynthesis protein ThiH  41.4 
 
 
372 aa  276  5e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  40.59 
 
 
369 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0728  thiazole biosynthesis protein ThiH  43.44 
 
 
372 aa  272  6e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00541403  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  38.6 
 
 
367 aa  271  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.29 
 
 
370 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  39.45 
 
 
374 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.77 
 
 
370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  38.26 
 
 
383 aa  265  7e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  38.79 
 
 
378 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  41.16 
 
 
369 aa  264  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.91 
 
 
374 aa  263  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  39.44 
 
 
371 aa  261  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.24 
 
 
371 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002077  thiazole biosynthesis protein ThiH  38.29 
 
 
370 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.25 
 
 
378 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2462  thiazole biosynthesis protein ThiH  38.78 
 
 
372 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.24 
 
 
371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  39.07 
 
 
369 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.37 
 
 
375 aa  259  6e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.48 
 
 
371 aa  259  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.95 
 
 
371 aa  258  2e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.19 
 
 
371 aa  256  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00361  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.96 
 
 
375 aa  256  6e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.9 
 
 
372 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.95 
 
 
368 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  39.13 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.19 
 
 
371 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.19 
 
 
371 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.36 
 
 
378 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.19 
 
 
371 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.9 
 
 
371 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2988  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.77 
 
 
370 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0342  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.71 
 
 
376 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3857  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.71 
 
 
376 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  37.43 
 
 
377 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.43 
 
 
377 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.22 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.43 
 
 
377 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2388  thiazole biosynthesis protein ThiH  37.39 
 
 
390 aa  243  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03866  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.14 
 
 
377 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4223  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.14 
 
 
377 aa  242  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5457  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.14 
 
 
377 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0848103 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0046  thiH protein  35.94 
 
 
382 aa  241  2e-62  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.081488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4437  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.43 
 
 
377 aa  240  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1855  thiamine biosynthesis protein ThiH  39.07 
 
 
371 aa  241  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2018  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.99 
 
 
374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.705115 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4480  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.86 
 
 
377 aa  240  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.63 
 
 
377 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03819  hypothetical protein  36.86 
 
 
377 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.1 
 
 
377 aa  239  5.999999999999999e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.44 
 
 
370 aa  236  4e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4565  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.34 
 
 
377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453457 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4489  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.34 
 
 
377 aa  235  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00456857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4369  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.34 
 
 
377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.34 
 
 
373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3720  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.78 
 
 
377 aa  234  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.526508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0215  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.05 
 
 
373 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1566  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.1 
 
 
363 aa  233  5e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0773107 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4402  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.05 
 
 
377 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0202  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.63 
 
 
377 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0117208 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2587  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.12 
 
 
369 aa  229  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.914294  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.31 
 
 
356 aa  229  8e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0664  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.97 
 
 
355 aa  229  8e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.428424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.78 
 
 
381 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.6 
 
 
366 aa  224  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1557  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.72 
 
 
356 aa  219  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.190528  normal  0.123415 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3075  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.63 
 
 
388 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.63 
 
 
354 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  32.01 
 
 
378 aa  211  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.72 
 
 
481 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.01 
 
 
477 aa  193  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1837  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.29 
 
 
388 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.151757  normal  0.173638 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.3 
 
 
467 aa  192  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.43 
 
 
469 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.94 
 
 
466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.56 
 
 
458 aa  188  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.8 
 
 
464 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.61 
 
 
471 aa  184  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.36 
 
 
458 aa  182  7e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.06 
 
 
469 aa  182  9.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>