220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0654 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 
458 aa  940    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.82 
 
 
481 aa  522  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.27 
 
 
469 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.39 
 
 
477 aa  518  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.09 
 
 
466 aa  518  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.99 
 
 
489 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.7 
 
 
490 aa  495  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.8 
 
 
492 aa  492  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  53.43 
 
 
468 aa  490  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.97 
 
 
471 aa  488  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.54 
 
 
473 aa  485  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.75 
 
 
473 aa  487  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.84 
 
 
467 aa  480  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.89 
 
 
473 aa  481  1e-134  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.22 
 
 
469 aa  474  1e-132  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.43 
 
 
464 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  48.72 
 
 
475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.57 
 
 
471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.32 
 
 
479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.87 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.11 
 
 
479 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.91 
 
 
467 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.11 
 
 
479 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  50 
 
 
491 aa  463  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.33 
 
 
487 aa  462  1e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.33 
 
 
458 aa  462  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  50.22 
 
 
474 aa  458  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.57 
 
 
474 aa  459  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.74 
 
 
469 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  49.13 
 
 
472 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.57 
 
 
472 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.95 
 
 
473 aa  435  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.78 
 
 
470 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.43 
 
 
472 aa  414  1e-114  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.9 
 
 
465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.13 
 
 
484 aa  405  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.17 
 
 
463 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.97 
 
 
370 aa  243  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  38.11 
 
 
383 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.42 
 
 
374 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  37.74 
 
 
372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  37.31 
 
 
378 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  37.66 
 
 
369 aa  230  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1855  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.49 
 
 
371 aa  229  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2462  thiazole biosynthesis protein ThiH  37.26 
 
 
372 aa  229  9e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.65 
 
 
371 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.36 
 
 
372 aa  226  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.86 
 
 
376 aa  225  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  38.13 
 
 
371 aa  224  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.65 
 
 
371 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.37 
 
 
371 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.17 
 
 
371 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.59 
 
 
370 aa  223  4.9999999999999996e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.08 
 
 
369 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.37 
 
 
371 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.56 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.16 
 
 
369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.99 
 
 
371 aa  220  3e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  36.75 
 
 
368 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.17 
 
 
356 aa  217  4e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  38.12 
 
 
367 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  35.36 
 
 
366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002077  thiazole biosynthesis protein ThiH  36.28 
 
 
370 aa  216  7e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.15 
 
 
375 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2018  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.65 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.705115 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.75 
 
 
378 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.15 
 
 
371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.45 
 
 
371 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.15 
 
 
371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2587  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.75 
 
 
369 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.914294  normal  0.0149307 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0046  thiH protein  35.5 
 
 
382 aa  212  1e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.081488  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0365  thiazole biosynthesis protein ThiH  34.69 
 
 
372 aa  212  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00361  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.94 
 
 
375 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.31 
 
 
378 aa  210  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.38 
 
 
370 aa  211  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.31 
 
 
369 aa  210  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1566  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.75 
 
 
363 aa  209  8e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0773107 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  34.38 
 
 
369 aa  208  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0342  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.24 
 
 
376 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3857  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.24 
 
 
376 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.76 
 
 
381 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.55 
 
 
366 aa  207  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.38 
 
 
370 aa  206  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  35.24 
 
 
367 aa  206  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2988  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.84 
 
 
370 aa  206  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.89 
 
 
414 aa  206  6e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1137  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.15 
 
 
430 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.867554  normal  0.132743 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.92 
 
 
373 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.56 
 
 
367 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.52 
 
 
389 aa  204  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0215  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.6 
 
 
373 aa  202  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4369  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.53 
 
 
377 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  31.22 
 
 
378 aa  202  8e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4565  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.12 
 
 
377 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000453457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.76 
 
 
377 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4402  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.12 
 
 
377 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3720  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.56 
 
 
377 aa  201  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.526508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4491  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.82 
 
 
377 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  hitchhiker  0.00000387053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.45 
 
 
377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.45 
 
 
377 aa  200  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>