190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0108 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  98.73 
 
 		 473 aa  954    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  100 
 
 		 473 aa  962    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0145  biotin and thiamin synthesis associated  60.17 
 
 		 475 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000404218  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  60.91 
 
 		 466 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  58.33 
 
 		 469 aa  588  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2150  thiamine biosynthesis protein ThiH  55.69 
 
 		 489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  56.76 
 
 		 477 aa  584  1.0000000000000001e-165  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1734  thiamine biosynthesis protein ThiH  57.45 
 
 		 467 aa  550  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.908145  normal  0.683505 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  56.25 
 
 		 468 aa  541  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  52.98 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2082  thiamine biosynthesis protein ThiH  52.37 
 
 		 472 aa  513  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.388177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3104  thiamine biosynthesis protein ThiH  54.09 
 
 		 470 aa  511  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0273  thiamine biosynthesis protein ThiH  51.52 
 
 		 472 aa  486  1e-136  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1553  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.11 
 
 		 471 aa  478  1e-133  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1504  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.47 
 
 		 473 aa  474  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0434134  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.16 
 
 		 484 aa  465  9.999999999999999e-131  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.43 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.25 
 
 		 481 aa  466  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  50.54 
 
 		 458 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.47 
 
 		 471 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.14 
 
 		 479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1241  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.39 
 
 		 492 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.721049  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.24 
 
 		 469 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.92 
 
 		 479 aa  450  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.71 
 
 		 479 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  48.42 
 
 		 490 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1390  thiamine biosynthesis protein ThiH  49.31 
 
 		 464 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00852808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.84 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.81 
 
 		 487 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.79 
 
 		 491 aa  438  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  47.01 
 
 		 474 aa  437  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1505  thiamine biosynthesis protein ThiH  46.45 
 
 		 467 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1607  biotin and thiamin synthesis associated  45.14 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0259922  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.16 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  44.78 
 
 		 458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  45.36 
 
 		 473 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.55 
 
 		 463 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1556  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.68 
 
 		 389 aa  209  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1853  thiamine biosynthesis protein ThiH  35.83 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.287617  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.07 
 
 		 369 aa  206  8e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.91 
 
 		 376 aa  204  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1598  thiazole biosynthesis protein ThiH  33.14 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1681  thiazole biosynthesis protein ThiH  33.33 
 
 		 366 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000164161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0799  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.66 
 
 		 414 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.07 
 
 		 367 aa  196  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.12 
 
 		 374 aa  196  9e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.41 
 
 		 370 aa  196  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.75 
 
 		 367 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.56 
 
 		 354 aa  190  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.1 
 
 		 369 aa  188  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2462  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.03 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  32.12 
 
 		 369 aa  187  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.06 
 
 		 385 aa  187  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0074  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.91 
 
 		 368 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.799799  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1822  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.97 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.113959 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.42 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3875  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.05 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0342  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.97 
 
 		 376 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3857  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.97 
 
 		 376 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3075  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.94 
 
 		 388 aa  183  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0626  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.52 
 
 		 369 aa  183  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6575  thiazole biosynthesis protein ThiH  30.06 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0279  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.11 
 
 		 377 aa  180  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544631 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0076  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.69 
 
 		 386 aa  179  1e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1557  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.9 
 
 		 356 aa  178  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.190528  normal  0.123415 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.82 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1065  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.56 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.73 
 
 		 381 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1188  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.12 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1775  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.45 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.89 
 
 		 356 aa  177  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2091  thiamine biosynthesis protein ThiH  32.23 
 
 		 372 aa  177  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2107  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.26 
 
 		 370 aa  177  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.85 
 
 		 374 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.85 
 
 		 372 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3720  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.48 
 
 		 377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.526508  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2434  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.55 
 
 		 371 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.360626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1566  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.46 
 
 		 363 aa  173  5e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0773107 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2196  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.23 
 
 		 371 aa  173  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.119873  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1137  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.49 
 
 		 430 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.867554  normal  0.132743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0215  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.21 
 
 		 373 aa  173  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0211  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.49 
 
 		 373 aa  173  6.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0244  thiamine biosynthesis protein  31.12 
 
 		 371 aa  173  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.913346 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1927  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.25 
 
 		 371 aa  172  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2448  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.82 
 
 		 370 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2378  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.02 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2440  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.27 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2029  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.25 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  29.18 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2027  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.55 
 
 		 371 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0728  thiazole biosynthesis protein ThiH  31.36 
 
 		 372 aa  171  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00541403  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4005  thiazole biosynthesis protein ThiH  29.01 
 
 		 377 aa  170  6e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4036  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.01 
 
 		 377 aa  170  6e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.781424  normal  0.0113886 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1886  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.18 
 
 		 371 aa  169  7e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1176  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.55 
 
 		 379 aa  169  7e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2092  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.18 
 
 		 371 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.62908 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5457  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.01 
 
 		 377 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0848103 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4531  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.18 
 
 		 377 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1941  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.95 
 
 		 371 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2318  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.95 
 
 		 371 aa  168  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>