More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1552 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  92.38 
 
 
341 aa  657    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  96.19 
 
 
341 aa  676    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  100 
 
 
341 aa  700    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  77.94 
 
 
341 aa  560  1e-158  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  73.1 
 
 
344 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  51.59 
 
 
349 aa  358  8e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1545  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 
337 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.160602  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  27.36 
 
 
354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  28.04 
 
 
351 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  30.57 
 
 
328 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  30.19 
 
 
328 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 
349 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1674  hypothetical protein  26.84 
 
 
343 aa  103  4e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  29.66 
 
 
345 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  29.26 
 
 
347 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  23.33 
 
 
365 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  26.46 
 
 
352 aa  99  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  28.89 
 
 
347 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0183  biotin synthase  32.59 
 
 
325 aa  96.7  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  25 
 
 
337 aa  96.7  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  22.61 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 
346 aa  93.2  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  27.18 
 
 
357 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  23.16 
 
 
368 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  32.51 
 
 
324 aa  93.2  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  28.2 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 
370 aa  92  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  27.15 
 
 
341 aa  92  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  25 
 
 
333 aa  90.9  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  27.27 
 
 
349 aa  90.5  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0552  biotin synthase  28.52 
 
 
338 aa  90.5  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 
380 aa  89.4  9e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  21.18 
 
 
350 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  29.77 
 
 
328 aa  88.6  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0352  biotin synthase  29.23 
 
 
326 aa  87.8  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.643225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1124  biotin synthase  26.89 
 
 
322 aa  87.8  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.568532  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  25.68 
 
 
350 aa  87.4  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  26.03 
 
 
328 aa  87  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  25.94 
 
 
320 aa  86.7  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  25.39 
 
 
360 aa  86.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4622  biotin synthase  27.13 
 
 
332 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151493 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  25.71 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  28.23 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  28.23 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  28.68 
 
 
324 aa  85.5  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2070  biotin synthase  25.83 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  27.09 
 
 
333 aa  85.1  0.000000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  29.13 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  27.3 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2168  biotin synthase  26.09 
 
 
335 aa  84.3  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  29.13 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0259  biotin synthase  28.02 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  23.82 
 
 
359 aa  84  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0436  biotin synthase  28.02 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726909 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26490  biotin synthase  27.07 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.197487 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1410  biotin synthase  26.37 
 
 
375 aa  82.4  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000875332  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0078  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.77 
 
 
330 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  24.71 
 
 
368 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1908  Biotin synthase  25.37 
 
 
370 aa  82  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  24.71 
 
 
368 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  24.36 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  23.78 
 
 
350 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  24.92 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  23.62 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2458  Biotin synthase  23.88 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  26.19 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 
364 aa  80.9  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  27.47 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1978  biotin synthase  25.28 
 
 
338 aa  80.5  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  27.13 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  23.55 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  29.67 
 
 
332 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1204  hypothetical protein  25.21 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  25.1 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  26.28 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1117  biotin synthase  27.78 
 
 
345 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  25 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  24.59 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  24.92 
 
 
348 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0559  biotin synthase  24.35 
 
 
299 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000654137  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  24.52 
 
 
351 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1928  biotin synthase  24.23 
 
 
376 aa  77  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000208086  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0618  biotin synthase  26.38 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.743089  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  25.17 
 
 
337 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  27.15 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  28.45 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1125  biotin synthetase  25.19 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  26.22 
 
 
388 aa  76.3  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1301  Biotin synthase  23.68 
 
 
316 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  23.44 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  27.52 
 
 
345 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  25.94 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  24.37 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  26.67 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0112  biotin synthase  24.1 
 
 
337 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2793  biotin synthase  28.64 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.883098  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  25.72 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09961  biotin synthase  27 
 
 
335 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>