288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1545 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1545  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 337 aa  694    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.160602  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1674  hypothetical protein  32.34 
 
 		 343 aa  181  2e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  28.57 
 
 		 341 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  27.82 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  28.09 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  27.53 
 
 		 341 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  27.53 
 
 		 344 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  26.07 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  28.91 
 
 		 826 aa  79.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0933  biotin synthase  25.26 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1040  biotin synthase  25.26 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.683221  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  24.68 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0464  biotin synthetase  27.04 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2242  biotin synthase  22.73 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0887115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  23.23 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2466  biotin synthase  24.62 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0190546 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  22.74 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  24.68 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1428  biotin synthase  26.06 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1556  biotin synthase  26.06 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0117  biotin synthase  24.8 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  24.69 
 
 		 336 aa  58.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0125  biotin synthase  25.09 
 
 		 362 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0600  biotin synthase  25.3 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  26.4 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06500  biotin synthase  24.65 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00342267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0998  biotin synthase  25.62 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  28.26 
 
 		 341 aa  56.6  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  21.51 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05980  Biotin synthase  26.9 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  23.91 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0618  biotin synthase  23.08 
 
 		 327 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.743089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4331  biotin synthase  25.16 
 
 		 321 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000173626  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0266  biotin synthase protein  24 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  23.33 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  22.3 
 
 		 328 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  26.27 
 
 		 350 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2286  biotin synthase  23.92 
 
 		 331 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0215942 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 346 aa  53.9  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4088  biotin synthase  23.69 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.629007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  22.18 
 
 		 311 aa  53.9  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1433  biotin synthase  23.02 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  29.41 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2813  biotin synthase  23.33 
 
 		 332 aa  53.1  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2359  biotin synthase  23.26 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000401407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2431  biotin synthase  23.26 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0409194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2519  biotin synthase  23.26 
 
 		 350 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000351956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0392  biotin synthase  23.72 
 
 		 352 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92095  normal  0.311291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  22.34 
 
 		 328 aa  53.1  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  24.48 
 
 		 349 aa  52.8  0.000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0362  biotin synthase  23.72 
 
 		 352 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.309451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2740  biotin synthase  23.26 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0388  biotin synthase  23.61 
 
 		 352 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.402949  normal  0.564151 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1536  biotin synthase  22.53 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2097  biotin synthase  23.73 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.178229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  24.52 
 
 		 354 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  27.36 
 
 		 331 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4840  biotin synthase  23.72 
 
 		 352 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.738334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5176  biotin synthase  23.72 
 
 		 351 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00545091  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0036  biotin synthase  22.92 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  24 
 
 		 320 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  23.2 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  28.96 
 
 		 404 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  21.88 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  23 
 
 		 329 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  23.63 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  29.94 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  26.61 
 
 		 330 aa  50.8  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  22.09 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0238  lipoyl synthase  27.04 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.39899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0020  biotin synthase  21.75 
 
 		 320 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000521068  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0711  biotin synthase  23.13 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  22.09 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  28.21 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0131  biotin synthase  24.17 
 
 		 340 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0592  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 371 aa  50.4  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000649486  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  21.96 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  21.96 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  21.96 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2111  biotin synthase  22.35 
 
 		 342 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  21.96 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  23.11 
 
 		 351 aa  50.1  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  21.96 
 
 		 339 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  21.96 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06643  biotin synthase (Eurofung)  25.1 
 
 		 393 aa  49.7  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1001  biotin synthase  24.25 
 
 		 364 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 497 aa  49.7  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0690  biotin synthase  24.67 
 
 		 361 aa  49.7  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.24033 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  24.58 
 
 		 321 aa  49.3  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  21.96 
 
 		 339 aa  49.3  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3644  biotin synthase  23.6 
 
 		 345 aa  49.7  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0494  biotin synthetase  24.11 
 
 		 352 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0657  biotin synthase  22.92 
 
 		 324 aa  49.3  0.00009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4006  biotin synthase  23.46 
 
 		 335 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  21.96 
 
 		 339 aa  49.3  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4375  biotin synthase  23.46 
 
 		 335 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2541  biotin synthase  24.12 
 
 		 337 aa  49.3  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179392  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>