More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1774 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  100 
 
 		 328 aa  661    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  80.49 
 
 		 333 aa  542  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  76.53 
 
 		 311 aa  507  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  76.6 
 
 		 324 aa  503  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  78.1 
 
 		 329 aa  502  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3328  lipoyl synthase  77.7 
 
 		 331 aa  498  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0213262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3288  lipoyl synthase  75.99 
 
 		 333 aa  499  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0066599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  77.45 
 
 		 309 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1340  lipoyl synthase  73.9 
 
 		 334 aa  494  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  76.64 
 
 		 305 aa  494  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3582  lipoyl synthase  75.16 
 
 		 332 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342819  normal  0.0560487 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  75.33 
 
 		 308 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  75.88 
 
 		 316 aa  491  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0914  lipoyl synthase  78.15 
 
 		 306 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455502  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1858  lipoyl synthase  76.32 
 
 		 332 aa  488  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3327  lipoyl synthase  76.39 
 
 		 325 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0977769 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3316  lipoyl synthase  76.39 
 
 		 325 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.237852  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2932  lipoyl synthase  73.97 
 
 		 317 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.512456 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3378  lipoyl synthase  76.39 
 
 		 325 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.093949 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0939  lipoic acid synthetase  75.33 
 
 		 317 aa  486  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.0375608 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1481  lipoyl synthase  76.33 
 
 		 339 aa  484  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.527679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3323  lipoyl synthase  77.3 
 
 		 308 aa  485  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.842671  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2035  lipoic acid synthetase  74.67 
 
 		 333 aa  484  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.616606  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12246  lipoyl synthase  77.12 
 
 		 311 aa  486  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.401424  normal  0.699705 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  76.59 
 
 		 333 aa  484  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0991  lipoyl synthase  74.43 
 
 		 312 aa  483  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0386773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1919  lipoyl synthase  74 
 
 		 320 aa  483  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0160088  decreased coverage  0.000217018 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3077  lipoic acid synthetase  77 
 
 		 342 aa  483  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1513  lipoic acid synthetase  76.01 
 
 		 341 aa  480  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.647542  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7406  lipoyl synthase  75.25 
 
 		 323 aa  474  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15400  lipoate synthase  71.79 
 
 		 333 aa  475  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2109  lipoic acid synthetase  75.33 
 
 		 337 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13370  lipoyl synthase  65.31 
 
 		 335 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.957716  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  65.03 
 
 		 347 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  65.03 
 
 		 339 aa  457  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  65.84 
 
 		 335 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1604  lipoyl synthase  65.84 
 
 		 335 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.159499  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0926  lipoyl synthase  73.08 
 
 		 323 aa  457  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.546117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16470  lipoyl synthase  65.78 
 
 		 340 aa  437  9.999999999999999e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.523399  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16380  lipoyl synthase  66.45 
 
 		 340 aa  433  1e-120  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0443181  normal  0.259676 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  54.58 
 
 		 303 aa  301  9e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  54.58 
 
 		 303 aa  301  9e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  49.64 
 
 		 291 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  49.66 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  54.01 
 
 		 328 aa  291  7e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  48.82 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  48.07 
 
 		 325 aa  285  9e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  47.74 
 
 		 351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  48.26 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  48.08 
 
 		 298 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  47.46 
 
 		 298 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  47.46 
 
 		 298 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  47.46 
 
 		 298 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  48.08 
 
 		 298 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  47.74 
 
 		 298 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  47.74 
 
 		 298 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  47.74 
 
 		 298 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  47.74 
 
 		 298 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  47.74 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  47.39 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  46.57 
 
 		 304 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3334  lipoyl synthase  48.38 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.117478  hitchhiker  0.00889782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  49.1 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0621  lipoyl synthase  47.89 
 
 		 338 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0719  lipoyl synthase  54.74 
 
 		 535 aa  276  3e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.219683  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4800  lipoyl synthase  47.54 
 
 		 338 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.269387 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  46.79 
 
 		 292 aa  276  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4675  lipoyl synthase  47.54 
 
 		 338 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  46.46 
 
 		 321 aa  276  5e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4853  lipoyl synthase  47.54 
 
 		 338 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  47.08 
 
 		 308 aa  275  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  47.62 
 
 		 298 aa  275  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  48.19 
 
 		 318 aa  275  9e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  50 
 
 		 320 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12130  lipoyl synthase  48.75 
 
 		 327 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08460  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  52.57 
 
 		 276 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  49.07 
 
 		 291 aa  273  3e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3093  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4963  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  47.49 
 
 		 320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  47.45 
 
 		 292 aa  272  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  45.87 
 
 		 315 aa  272  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4358  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 335 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.383654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  48.62 
 
 		 298 aa  272  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1113  lipoyl synthase  48.74 
 
 		 323 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0245  lipoyl synthase  47.1 
 
 		 315 aa  272  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  47.72 
 
 		 323 aa  271  9e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  46.67 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  47.97 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  49.28 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  43.92 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  46.72 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  48.28 
 
 		 298 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  45.99 
 
 		 288 aa  270  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  44.52 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  45.82 
 
 		 317 aa  268  7e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  47.65 
 
 		 337 aa  268  7e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>