214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1302 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  100 
 
 		 330 aa  679    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  64.81 
 
 		 325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  52.02 
 
 		 329 aa  353  2e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  52.35 
 
 		 565 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  54.09 
 
 		 327 aa  352  5e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  55.03 
 
 		 331 aa  349  3e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  54.49 
 
 		 326 aa  348  1e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  52.2 
 
 		 321 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  48.42 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  48.4 
 
 		 351 aa  294  1e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  49.04 
 
 		 352 aa  291  8e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  48.72 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  48.72 
 
 		 352 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  44.31 
 
 		 368 aa  278  1e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  43.32 
 
 		 380 aa  276  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  41.84 
 
 		 392 aa  272  7e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  43.82 
 
 		 792 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  42.77 
 
 		 800 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  40.77 
 
 		 820 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  47.51 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  42.9 
 
 		 372 aa  260  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.22 
 
 		 419 aa  259  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.65 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  44.63 
 
 		 387 aa  256  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  44.34 
 
 		 386 aa  255  8e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  43.11 
 
 		 826 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  42.39 
 
 		 860 aa  253  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  42.94 
 
 		 852 aa  252  5.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  40.83 
 
 		 779 aa  252  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  40.95 
 
 		 838 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  41.23 
 
 		 836 aa  250  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  43.88 
 
 		 884 aa  250  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.07 
 
 		 863 aa  249  6e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  42.4 
 
 		 881 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  40 
 
 		 867 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  42.26 
 
 		 859 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  42.26 
 
 		 859 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  40.72 
 
 		 859 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  41.96 
 
 		 859 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 390 aa  242  7e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  41.02 
 
 		 857 aa  242  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  41.11 
 
 		 859 aa  241  9e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  40.18 
 
 		 416 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.68 
 
 		 875 aa  239  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  41.07 
 
 		 859 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  38.75 
 
 		 871 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  41.11 
 
 		 856 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  39.12 
 
 		 811 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  43.22 
 
 		 841 aa  233  3e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  40.95 
 
 		 430 aa  233  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  38.84 
 
 		 841 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.51 
 
 		 872 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  37.01 
 
 		 842 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.75 
 
 		 741 aa  222  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  39.64 
 
 		 757 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  39.76 
 
 		 944 aa  209  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.86 
 
 		 737 aa  208  9e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  40.32 
 
 		 336 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  39.76 
 
 		 899 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.71 
 
 		 737 aa  206  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  38.87 
 
 		 340 aa  198  7.999999999999999e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  39.38 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  38.53 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  38.53 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  38.96 
 
 		 307 aa  189  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  38.98 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  36.5 
 
 		 325 aa  176  4e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  28.44 
 
 		 364 aa  87  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 362 aa  78.2  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  28.36 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  26.56 
 
 		 361 aa  76.3  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  27.3 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  25.63 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 362 aa  67  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 		 419 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  29.08 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  25.35 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  25.33 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  28.57 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  27.9 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  22.41 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  24.6 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  25.08 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  29.25 
 
 		 341 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  25.1 
 
 		 350 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  23.91 
 
 		 374 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  27.1 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  30.32 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  26.09 
 
 		 370 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2405  biotin synthase  25.56 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 364 aa  55.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  25.33 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  24.56 
 
 		 311 aa  54.7  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  25.1 
 
 		 349 aa  53.9  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  26.06 
 
 		 359 aa  54.3  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  23.92 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>