More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0166 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0166  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 370 aa  736    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.372295  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2151  biotin synthase  54.44 
 
 		 354 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  60.24 
 
 		 360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  50.72 
 
 		 350 aa  351  8.999999999999999e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0181  Radical SAM domain protein  53.5 
 
 		 349 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0841  biotin synthase  52.58 
 
 		 344 aa  339  5e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  48.05 
 
 		 345 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  46.18 
 
 		 351 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1735  biotin synthase  56.01 
 
 		 350 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00262623  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1551  biotin synthase  53.36 
 
 		 348 aa  322  6e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0240  biotin synthase  48.14 
 
 		 349 aa  317  2e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2462  biotin synthase  49.69 
 
 		 347 aa  316  5e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1597  biotin synthase  47.47 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1502  biotin synthase  52.01 
 
 		 348 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000209115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2775  biotin synthase  49.69 
 
 		 347 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  45.54 
 
 		 352 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0144  Radical SAM domain protein  52.26 
 
 		 352 aa  295  8e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000047373  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  43.65 
 
 		 346 aa  292  6e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1388  biotin synthase  51.02 
 
 		 323 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00378301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1632  biotin synthase  45.91 
 
 		 356 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000234633  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1863  radical SAM domain-containing protein  40.06 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.176912  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1722  biotin synthase  43.73 
 
 		 348 aa  269  5e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000337366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2083  biotin synthase  43 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  45.94 
 
 		 353 aa  262  6e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1491  biotin synthase  42.52 
 
 		 357 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1607  biotin synthase  44.31 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.18444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2277  biotin synthase  52.69 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  40.59 
 
 		 345 aa  260  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1844  biotin synthase  45.12 
 
 		 360 aa  255  8e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  43.66 
 
 		 347 aa  251  1e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  47.06 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2639  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 		 374 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1504  biotin synthase  48.32 
 
 		 331 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3925  biotin synthase  42.47 
 
 		 359 aa  232  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1020  biotin synthase  44.44 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3255  biotin synthase  41.1 
 
 		 359 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.464529  hitchhiker  0.000014228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0706  biotin synthase  41.78 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.997344  hitchhiker  0.000263623 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  35.57 
 
 		 364 aa  222  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4857  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 		 365 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0838  biotin synthase  29.32 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0028  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2085  biotin synthase  28.03 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000297943  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  24.21 
 
 		 341 aa  96.3  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1125  biotin synthase  24.84 
 
 		 341 aa  93.2  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  23.58 
 
 		 341 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  32.53 
 
 		 328 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  31.56 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0034  biotin synthase  27.86 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  25.91 
 
 		 344 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2637  biotin and thiamin synthesis associated  23.97 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0455456  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2081  biotin synthetase  27.78 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1131  biotin synthase  24.21 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.51 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  23.78 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0340  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.13 
 
 		 374 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0141  biotin synthase  26.48 
 
 		 368 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000566121 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  28.46 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0106  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.35 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0108  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.35 
 
 		 473 aa  72  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3253  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.75 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000173942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4971  biotin synthase  25.95 
 
 		 359 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.819396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0144  biotin synthase  26.48 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16500  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.74 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  30.94 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1841  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.48 
 
 		 490 aa  70.1  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0513393  normal  0.233409 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  26.76 
 
 		 345 aa  70.1  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.35 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000108196  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  24.83 
 
 		 321 aa  69.7  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0169  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.61 
 
 		 477 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000784524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0608  thiamine biosynthesis protein ThiH  29.55 
 
 		 370 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499964  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0708  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.41 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.519768  hitchhiker  0.000306942 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  24.34 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1582  biotin synthase  27.8 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.322935  normal  0.369055 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2278  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.8 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.751586  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0842  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.83 
 
 		 468 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.61 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2053  biotin synthase  25 
 
 		 328 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3923  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.33 
 
 		 479 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2164  biotin synthase  25 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0182  thiamine biosynthesis protein ThiH  27.7 
 
 		 469 aa  67  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  23.75 
 
 		 333 aa  67  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.51 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  25 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1795  biotin synthase  25.35 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1599  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.98 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0238  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.1 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19320  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.73 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.604255  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3562  biotin synthase  29.05 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0246986 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  25.54 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1946  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.21 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.236284  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2823  biotin synthase  24.25 
 
 		 336 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  27.42 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1584  biotin synthetase  29.18 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120717  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.47 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  26.89 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  30.77 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  25.1 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3108  biotin synthase  26.36 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1492  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.57 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1458  biotin synthase  26.26 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.64214e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>