204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0058 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  100 
 
 		 419 aa  835    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  50.68 
 
 		 800 aa  334  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  49.45 
 
 		 386 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  53.94 
 
 		 792 aa  325  1e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  49.71 
 
 		 380 aa  322  7e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  45.33 
 
 		 392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  47.52 
 
 		 826 aa  310  4e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  52.31 
 
 		 779 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  49.54 
 
 		 820 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  39.52 
 
 		 390 aa  300  4e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  46.97 
 
 		 856 aa  295  8e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  48.05 
 
 		 881 aa  290  3e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  46.59 
 
 		 871 aa  290  4e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  45.5 
 
 		 859 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  45.5 
 
 		 859 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  45.41 
 
 		 836 aa  286  5.999999999999999e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  44.97 
 
 		 859 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  45.82 
 
 		 860 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  47.52 
 
 		 859 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  44.66 
 
 		 859 aa  282  8.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  47 
 
 		 867 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  46.11 
 
 		 416 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  46.88 
 
 		 863 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  41.74 
 
 		 380 aa  280  4e-74  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  45.48 
 
 		 859 aa  276  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  45.07 
 
 		 842 aa  276  7e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  50.15 
 
 		 884 aa  275  8e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  47 
 
 		 857 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  47 
 
 		 875 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  44.68 
 
 		 838 aa  274  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  45.74 
 
 		 329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  49.56 
 
 		 899 aa  270  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  47.18 
 
 		 852 aa  270  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  46.09 
 
 		 872 aa  270  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  44.79 
 
 		 565 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  44.81 
 
 		 841 aa  268  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  48.3 
 
 		 841 aa  267  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  39.44 
 
 		 351 aa  266  7e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  39.22 
 
 		 352 aa  265  8e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  40.88 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  46.75 
 
 		 331 aa  264  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  40.57 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  43.03 
 
 		 325 aa  264  3e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  44.07 
 
 		 757 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  47.18 
 
 		 944 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  43.22 
 
 		 330 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  45.91 
 
 		 327 aa  256  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  44.21 
 
 		 430 aa  256  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  43.42 
 
 		 811 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  46.98 
 
 		 326 aa  250  4e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  42.44 
 
 		 368 aa  242  9e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  44.65 
 
 		 389 aa  241  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  45 
 
 		 393 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  42.86 
 
 		 321 aa  241  2e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  44.88 
 
 		 372 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  43.3 
 
 		 387 aa  232  7.000000000000001e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.19 
 
 		 741 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  38.07 
 
 		 336 aa  196  9e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.03 
 
 		 737 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  36.48 
 
 		 319 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  38.58 
 
 		 321 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  39.13 
 
 		 318 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  39.13 
 
 		 318 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  37.61 
 
 		 340 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.18 
 
 		 737 aa  175  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  38.12 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  37.87 
 
 		 325 aa  170  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 515 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  25.44 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  23.73 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 359 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  24.59 
 
 		 396 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  27.69 
 
 		 373 aa  61.6  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  23.23 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  26.18 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  22.74 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  27.65 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 626 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 626 aa  59.7  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  25.64 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  24.37 
 
 		 360 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  24.34 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  25.89 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  25.16 
 
 		 626 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 367 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  24.05 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>