223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2097 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  100 
 
 		 376 aa  781    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  79.12 
 
 		 391 aa  612  9.999999999999999e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  63.71 
 
 		 396 aa  501  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  51.23 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  48.76 
 
 		 367 aa  360  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  49.58 
 
 		 368 aa  358  9e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 388 aa  357  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  50 
 
 		 388 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  49.46 
 
 		 388 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  48.61 
 
 		 368 aa  354  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  47.22 
 
 		 360 aa  355  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  46.39 
 
 		 367 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  46.98 
 
 		 373 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  49.02 
 
 		 362 aa  345  8.999999999999999e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  43.13 
 
 		 373 aa  343  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  42.78 
 
 		 364 aa  342  9e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  47.78 
 
 		 361 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  46.11 
 
 		 360 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  46.09 
 
 		 367 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  47.47 
 
 		 373 aa  336  5e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  45.4 
 
 		 359 aa  333  2e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  45.68 
 
 		 358 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  45.25 
 
 		 372 aa  332  5e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  44.69 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  45.13 
 
 		 358 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  45.53 
 
 		 367 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  47.11 
 
 		 380 aa  330  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  46.15 
 
 		 387 aa  330  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  44.04 
 
 		 359 aa  329  6e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  43.33 
 
 		 359 aa  317  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  44.66 
 
 		 386 aa  316  5e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  45.68 
 
 		 384 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  42.47 
 
 		 393 aa  310  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  41.29 
 
 		 353 aa  300  3e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  41.19 
 
 		 397 aa  296  3e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 390 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  39.39 
 
 		 353 aa  293  3e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  43.79 
 
 		 358 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  42.09 
 
 		 386 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  40.67 
 
 		 360 aa  290  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 		 389 aa  285  8e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  40.45 
 
 		 353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  42.46 
 
 		 382 aa  282  7.000000000000001e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  40.43 
 
 		 389 aa  282  7.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  38.4 
 
 		 360 aa  281  1e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  38.44 
 
 		 354 aa  279  5e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  42.9 
 
 		 392 aa  279  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  40.22 
 
 		 354 aa  275  9e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  39.08 
 
 		 348 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  38.78 
 
 		 354 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  38.46 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  38.16 
 
 		 354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  39.13 
 
 		 358 aa  268  8e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  38.16 
 
 		 354 aa  267  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  39.32 
 
 		 355 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  37.92 
 
 		 365 aa  262  6e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  38 
 
 		 350 aa  262  8.999999999999999e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  40.9 
 
 		 360 aa  261  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  38.48 
 
 		 360 aa  260  2e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  38.97 
 
 		 348 aa  260  3e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  38.4 
 
 		 363 aa  259  5.0000000000000005e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  41.39 
 
 		 355 aa  256  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  35.98 
 
 		 352 aa  253  3e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  39.55 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  38.06 
 
 		 355 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  36.24 
 
 		 356 aa  248  8e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0710  hypothetical protein  36.66 
 
 		 369 aa  247  3e-64  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  36.21 
 
 		 359 aa  246  4e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  38.97 
 
 		 348 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  38.68 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  37.19 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  38.68 
 
 		 348 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  38.27 
 
 		 371 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  35.53 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  40.38 
 
 		 356 aa  240  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  36.67 
 
 		 364 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  37.61 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  36.86 
 
 		 384 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  36.03 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  35.83 
 
 		 375 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  37.25 
 
 		 353 aa  236  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  36.9 
 
 		 357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  34.35 
 
 		 356 aa  233  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  36.57 
 
 		 357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  38.18 
 
 		 354 aa  233  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  35.67 
 
 		 345 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  36.1 
 
 		 348 aa  231  1e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  37.32 
 
 		 369 aa  231  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  36.73 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  33.15 
 
 		 404 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  34.99 
 
 		 386 aa  229  6e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  38.79 
 
 		 357 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  35.82 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  32.79 
 
 		 372 aa  229  8e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  36.62 
 
 		 367 aa  228  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  36.5 
 
 		 376 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  35.15 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  33.43 
 
 		 396 aa  226  7e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  35.36 
 
 		 353 aa  225  8e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  35.77 
 
 		 365 aa  225  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>