92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0367 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  100 
 
 
307 aa  630  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  72.22 
 
 
318 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  71.9 
 
 
318 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  68.75 
 
 
340 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  64.92 
 
 
319 aa  425  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  70.23 
 
 
325 aa  418  1e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  65.36 
 
 
321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  64.47 
 
 
336 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  43.14 
 
 
326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  41.1 
 
 
565 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  38.96 
 
 
330 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  39.17 
 
 
331 aa  190  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  39.48 
 
 
329 aa  186  4e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  39.31 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  38.71 
 
 
325 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  38.12 
 
 
419 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.71 
 
 
741 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  36.22 
 
 
321 aa  180  2e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  37.91 
 
 
368 aa  175  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  35.47 
 
 
737 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  37.38 
 
 
826 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  37.46 
 
 
389 aa  172  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.05 
 
 
737 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  36.79 
 
 
380 aa  167  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  35.2 
 
 
352 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  35.26 
 
 
351 aa  166  5e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  35.35 
 
 
387 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  35.11 
 
 
352 aa  163  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  34.58 
 
 
352 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  34.27 
 
 
838 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  35.69 
 
 
372 aa  159  4e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  34.42 
 
 
393 aa  158  9e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  34.58 
 
 
841 aa  156  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  34.29 
 
 
792 aa  155  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  42.15 
 
 
800 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  34.6 
 
 
881 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  36.68 
 
 
884 aa  153  4e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  34.08 
 
 
392 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  34.86 
 
 
852 aa  152  7e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  33.85 
 
 
859 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  33.85 
 
 
859 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  33.85 
 
 
859 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  34.16 
 
 
841 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  35.13 
 
 
860 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  34.07 
 
 
416 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  33.64 
 
 
842 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  32.7 
 
 
859 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  34.98 
 
 
871 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  33.75 
 
 
820 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.44 
 
 
863 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  35.46 
 
 
380 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  34.49 
 
 
836 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  32.61 
 
 
859 aa  146  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  36.25 
 
 
757 aa  145  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  35.24 
 
 
857 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  34.38 
 
 
856 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  32.38 
 
 
867 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  33.65 
 
 
859 aa  140  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  34.49 
 
 
944 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  34.92 
 
 
899 aa  136  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  31.85 
 
 
430 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  32.43 
 
 
811 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  31.66 
 
 
875 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  32.92 
 
 
872 aa  130  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  31.31 
 
 
779 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  33.44 
 
 
386 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1268  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.54 
 
 
356 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0370  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.51 
 
 
369 aa  55.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000304803  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  23.89 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  24.02 
 
 
367 aa  49.7  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.04 
 
 
378 aa  49.7  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1632  biotin synthase  21.84 
 
 
331 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2251  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 
462 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.677683 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  22.26 
 
 
360 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2167  thiazole biosynthesis protein ThiH  25.77 
 
 
374 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.26 
 
 
385 aa  46.6  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.5 
 
 
458 aa  46.2  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0775  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.15 
 
 
370 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  22.01 
 
 
357 aa  45.4  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2647  biotin synthase  22.68 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000036845  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1570  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.16 
 
 
367 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.25811  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2004  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.84 
 
 
366 aa  43.9  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0664  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.29 
 
 
355 aa  43.5  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.428424  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1394  biotin synthase  21.8 
 
 
333 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  29.85 
 
 
386 aa  42.7  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1658  thiamine biosynthesis protein ThiH  20.93 
 
 
369 aa  42.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.86 
 
 
376 aa  43.1  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  23.21 
 
 
355 aa  42.7  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  22.81 
 
 
402 aa  42.7  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0737  thiamine biosynthesis protein ThiH  22.73 
 
 
381 aa  42.4  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1147  thiamine biosynthesis protein ThiH  21.38 
 
 
377 aa  42.4  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000413421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>