More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0975 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  50.26 
 
 
859 aa  712    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  50.64 
 
 
859 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  48.09 
 
 
871 aa  698    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  50.46 
 
 
838 aa  692    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  50.64 
 
 
872 aa  712    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  47.67 
 
 
867 aa  669    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  50 
 
 
856 aa  711    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  49.1 
 
 
875 aa  702    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  51.39 
 
 
841 aa  749    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  51.23 
 
 
836 aa  721    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  55.98 
 
 
820 aa  858    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  54.57 
 
 
826 aa  808    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  50.77 
 
 
859 aa  719    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  100 
 
 
792 aa  1590    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  57.34 
 
 
779 aa  775    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  47.26 
 
 
857 aa  688    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  48.99 
 
 
859 aa  710    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  50.52 
 
 
863 aa  723    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  64.85 
 
 
800 aa  980    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  50.25 
 
 
884 aa  689    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  53.29 
 
 
757 aa  697    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  49.02 
 
 
842 aa  711    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  48.74 
 
 
852 aa  709    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  48.33 
 
 
841 aa  687    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  50.77 
 
 
859 aa  719    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  50.39 
 
 
859 aa  719    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  51.39 
 
 
881 aa  696    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  43.86 
 
 
811 aa  538  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.6 
 
 
741 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.62 
 
 
737 aa  478  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.53 
 
 
737 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  52.94 
 
 
392 aa  392  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  59.12 
 
 
860 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  50.9 
 
 
418 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  55.78 
 
 
386 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  51.84 
 
 
944 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  51.73 
 
 
899 aa  375  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  52.42 
 
 
380 aa  375  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  47.17 
 
 
429 aa  369  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  50.93 
 
 
416 aa  363  5.0000000000000005e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  52.38 
 
 
435 aa  362  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  55.56 
 
 
430 aa  358  1.9999999999999998e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  46.94 
 
 
359 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  44.84 
 
 
362 aa  331  3e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  46.91 
 
 
370 aa  329  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  45 
 
 
419 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  48.48 
 
 
358 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  45.86 
 
 
359 aa  328  3e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  49.71 
 
 
453 aa  328  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  43.73 
 
 
359 aa  324  5e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  52.98 
 
 
419 aa  319  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  38.38 
 
 
390 aa  315  1.9999999999999998e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  46.59 
 
 
367 aa  311  4e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  44.85 
 
 
362 aa  310  9e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  47.43 
 
 
376 aa  305  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  46.44 
 
 
365 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  43.09 
 
 
352 aa  300  7e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  46.18 
 
 
352 aa  297  5e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  42.42 
 
 
351 aa  295  2e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  44.51 
 
 
380 aa  292  1e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  40.78 
 
 
358 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  45.57 
 
 
352 aa  289  1e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  43.07 
 
 
366 aa  289  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  44.35 
 
 
361 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  45.92 
 
 
356 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  44.12 
 
 
362 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  46.13 
 
 
565 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  47.54 
 
 
387 aa  282  2e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  43.24 
 
 
384 aa  281  5e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  41.55 
 
 
391 aa  277  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  43.82 
 
 
330 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  48.6 
 
 
368 aa  274  4.0000000000000004e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  41.55 
 
 
376 aa  270  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  41.3 
 
 
325 aa  270  8.999999999999999e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  43.02 
 
 
364 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  46.95 
 
 
331 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  41.26 
 
 
361 aa  267  5.999999999999999e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  39.69 
 
 
398 aa  266  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  43.73 
 
 
329 aa  266  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  41.94 
 
 
381 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.67 
 
 
382 aa  264  4.999999999999999e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  41.81 
 
 
362 aa  263  6e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  45.54 
 
 
389 aa  263  8.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  39.28 
 
 
358 aa  262  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  48.56 
 
 
393 aa  262  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  39.7 
 
 
356 aa  261  4e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  39.55 
 
 
358 aa  259  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  44.34 
 
 
327 aa  259  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  38.36 
 
 
384 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  38.63 
 
 
384 aa  257  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  41.24 
 
 
386 aa  256  8e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  40.73 
 
 
360 aa  256  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  44.65 
 
 
372 aa  244  3e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  41.24 
 
 
360 aa  243  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  40.17 
 
 
361 aa  241  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  42.54 
 
 
321 aa  238  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3326  FO synthase  38.27 
 
 
372 aa  238  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.9768  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  37.75 
 
 
355 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  39.09 
 
 
371 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  39.15 
 
 
368 aa  235  3e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>