More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1253 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  100 
 
 
565 aa  1165    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  62.96 
 
 
329 aa  419  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  61.06 
 
 
327 aa  411  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  60.94 
 
 
321 aa  411  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  60.8 
 
 
331 aa  405  1e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  55.66 
 
 
325 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  52.35 
 
 
330 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  52.34 
 
 
326 aa  317  3e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  47.02 
 
 
368 aa  301  3e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  49.68 
 
 
380 aa  297  3e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  46.39 
 
 
392 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  48.35 
 
 
881 aa  289  8e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  40.8 
 
 
856 aa  289  1e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  40.57 
 
 
859 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  40.57 
 
 
859 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  48.84 
 
 
387 aa  287  5e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  48.34 
 
 
393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  44.73 
 
 
867 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  40.33 
 
 
859 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  45.11 
 
 
372 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  47.89 
 
 
857 aa  283  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  46.27 
 
 
352 aa  283  8.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  47.06 
 
 
800 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  45.66 
 
 
860 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  46.75 
 
 
836 aa  281  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  45.96 
 
 
352 aa  280  4e-74  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  46.13 
 
 
792 aa  280  4e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.45 
 
 
863 aa  280  7e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  45.51 
 
 
859 aa  279  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  45.65 
 
 
352 aa  279  9e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  43.77 
 
 
871 aa  277  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  40.05 
 
 
859 aa  278  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  43.75 
 
 
859 aa  277  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  42.63 
 
 
826 aa  276  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  46 
 
 
389 aa  276  7e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  48.39 
 
 
351 aa  276  7e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  45.86 
 
 
416 aa  276  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.06 
 
 
875 aa  273  5.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.7 
 
 
872 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2202  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  59.21 
 
 
256 aa  268  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  47.22 
 
 
852 aa  269  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  44.79 
 
 
419 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  45.65 
 
 
820 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  44.41 
 
 
838 aa  264  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  43.49 
 
 
811 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  45.05 
 
 
380 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  46.13 
 
 
386 aa  261  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  41.98 
 
 
842 aa  261  3e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  46.77 
 
 
779 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  42.39 
 
 
841 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  46.69 
 
 
884 aa  258  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0531  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  53.28 
 
 
237 aa  256  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1839  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  55.51 
 
 
241 aa  252  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0830136  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2042  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  50.43 
 
 
238 aa  250  5e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00488373  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  43.55 
 
 
899 aa  243  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1694  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  51.71 
 
 
244 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  42.62 
 
 
841 aa  240  4e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  40.66 
 
 
944 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  42.49 
 
 
430 aa  236  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1067  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  51.27 
 
 
245 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.592657  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1445  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  47.86 
 
 
242 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0340499  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1559  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  51.27 
 
 
245 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.231473 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  40.13 
 
 
390 aa  232  2e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0352  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  50.85 
 
 
245 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00889604  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  43.18 
 
 
757 aa  228  2e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.88 
 
 
737 aa  223  7e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.65 
 
 
741 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1474  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  48.67 
 
 
238 aa  218  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0394  phosphoribosylaminoimidazole- succinocarboxamides ynthase  47.14 
 
 
239 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.756267  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0468  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  48.09 
 
 
242 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0730  phosphoribosylaminoimidazole- succinocarboxamides ynthase  45.65 
 
 
246 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.9268  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1057  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  47.6 
 
 
235 aa  213  7e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  40.97 
 
 
319 aa  212  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0308  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  47.37 
 
 
241 aa  212  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.711498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1452  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  45.06 
 
 
239 aa  212  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2120  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  45.45 
 
 
250 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.36 
 
 
737 aa  211  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1131  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  48.25 
 
 
233 aa  211  4e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0263  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  44.93 
 
 
239 aa  210  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0364  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  44.93 
 
 
239 aa  210  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0323  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  44.93 
 
 
239 aa  210  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0320  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  44.93 
 
 
239 aa  210  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0278  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  44.93 
 
 
239 aa  210  6e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0266  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  44.93 
 
 
239 aa  210  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.891327  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0291  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  44.93 
 
 
239 aa  210  6e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2355  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  46.9 
 
 
240 aa  210  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1989  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  46.9 
 
 
240 aa  210  7e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0270  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  44.49 
 
 
239 aa  209  7e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4983  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  44.49 
 
 
239 aa  209  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0337  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  44.49 
 
 
239 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.921002  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0256  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  45.92 
 
 
242 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.067153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1132  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  48.07 
 
 
242 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0067  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  47.62 
 
 
241 aa  208  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.456741  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  41.09 
 
 
318 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1240  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  46.02 
 
 
236 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.484616  normal  0.849303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1270  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  46.02 
 
 
236 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.473469  normal  0.711373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3972  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  46.02 
 
 
236 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317412  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2051  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  44.59 
 
 
244 aa  206  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.543494  normal  0.0943036 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1956  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  46.93 
 
 
238 aa  206  9e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.158323  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2126  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  47.35 
 
 
239 aa  206  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>