91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0173 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  100 
 
 		 319 aa  651    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  63.9 
 
 		 318 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  63.9 
 
 		 318 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  65.81 
 
 		 340 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  64.92 
 
 		 307 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  61.66 
 
 		 321 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  63.76 
 
 		 325 aa  386  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  57.56 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  40.97 
 
 		 565 aa  212  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  42.14 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  37.61 
 
 		 321 aa  195  9e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  39.38 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  36.45 
 
 		 368 aa  193  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  37.65 
 
 		 329 aa  191  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  40.32 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  35.89 
 
 		 792 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  36.45 
 
 		 331 aa  189  7e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  34.5 
 
 		 419 aa  189  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  35.37 
 
 		 327 aa  186  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  35.5 
 
 		 387 aa  183  3e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  36.3 
 
 		 389 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  35.13 
 
 		 393 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.38 
 
 		 737 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  33.05 
 
 		 741 aa  179  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  34.15 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  36.99 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  32.9 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  38.22 
 
 		 380 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  37.27 
 
 		 352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  36.28 
 
 		 352 aa  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  35.61 
 
 		 841 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.38 
 
 		 737 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  36.28 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  34.6 
 
 		 392 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  34.8 
 
 		 838 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  34.82 
 
 		 800 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  35.53 
 
 		 856 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  31.79 
 
 		 820 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  33.12 
 
 		 859 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  33.12 
 
 		 859 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  32.83 
 
 		 881 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  34.08 
 
 		 826 aa  162  8.000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  36.91 
 
 		 380 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  33.12 
 
 		 859 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  33.54 
 
 		 859 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  35.6 
 
 		 860 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  32.84 
 
 		 416 aa  159  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  33.33 
 
 		 859 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  35.56 
 
 		 386 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  34.47 
 
 		 842 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  34.98 
 
 		 852 aa  155  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  34.6 
 
 		 884 aa  155  7e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  34.28 
 
 		 863 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  34.37 
 
 		 836 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  33.54 
 
 		 841 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  33.54 
 
 		 779 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 859 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  32.7 
 
 		 867 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  33.33 
 
 		 871 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  34.39 
 
 		 857 aa  145  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  30.79 
 
 		 430 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  35.38 
 
 		 757 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  32.6 
 
 		 811 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  33.43 
 
 		 944 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  32.08 
 
 		 872 aa  140  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  31.66 
 
 		 875 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  34.39 
 
 		 899 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  25.12 
 
 		 360 aa  49.3  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  22.66 
 
 		 355 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1917  thiazole biosynthesis protein ThiH  28.82 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 362 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0163  thiamine biosynthesis protein ThiH  31.93 
 
 		 491 aa  47.4  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2753  thiamine biosynthesis protein ThiH  34.72 
 
 		 465 aa  47.4  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1333  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.55 
 
 		 458 aa  47  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000230637  unclonable  1.1198e-18 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1864  thiamine biosynthesis protein ThiH  36.23 
 
 		 471 aa  46.2  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.804214  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1631  thiamine biosynthesis protein ThiH  24.42 
 
 		 385 aa  44.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 365 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0654  thiamine biosynthesis protein ThiH  33.73 
 
 		 458 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 353 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  28.9 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00141  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.44 
 
 		 378 aa  43.5  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 		 369 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1022  thiamine biosynthesis protein ThiH  37.68 
 
 		 487 aa  43.1  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2251  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 462 aa  43.1  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.677683 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1664  thiamine biosynthesis protein ThiH  25.16 
 
 		 376 aa  43.1  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.198557  hitchhiker  0.0013298 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0599  thiazole biosynthesis protein ThiH  28.57 
 
 		 369 aa  43.1  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0530  thiamine biosynthesis protein ThiH  23.16 
 
 		 466 aa  42.4  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1117  biotin and thiamin synthesis associated  29.09 
 
 		 378 aa  42.4  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>