168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2251 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2251  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 462 aa  950    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.677683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1615  Radical SAM domain protein  47.77 
 
 		 464 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1714  Radical SAM domain protein  47.54 
 
 		 464 aa  432  1e-120  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.540627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2894  radical SAM domain-containing protein  46.41 
 
 		 462 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00476691  normal  0.460921 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  33.55 
 
 		 484 aa  259  6e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0737  radical SAM domain-containing protein  31.39 
 
 		 480 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 		 487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  28.71 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  24.4 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.06 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  25.22 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 476 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 391 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  22.5 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 518 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  21.51 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  21.69 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 		 290 aa  57  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  27.91 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  29.67 
 
 		 379 aa  55.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 323 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2847  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  25.73 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3249  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  25.73 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.792504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 		 323 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  24.68 
 
 		 401 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2425  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 434 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.200383  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 464 aa  54.7  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  21.59 
 
 		 481 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0826  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  24.8 
 
 		 337 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.256838 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 332 aa  54.3  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 439 aa  54.7  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 460 aa  54.3  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 460 aa  53.9  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  23.06 
 
 		 375 aa  53.5  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 327 aa  53.5  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1015  radical SAM family Fe-S protein  25.91 
 
 		 366 aa  53.5  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0391907  normal  0.466336 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  20.59 
 
 		 461 aa  53.5  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  29.07 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0685  radical SAM domain-containing protein  26.75 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460157  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1726  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 405 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  23.43 
 
 		 399 aa  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3363  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  28.09 
 
 		 332 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 477 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 389 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  21.77 
 
 		 463 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 351 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  21.59 
 
 		 477 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 383 aa  51.6  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6513  Radical SAM domain protein  22.03 
 
 		 418 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.214971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  25.14 
 
 		 486 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  23.88 
 
 		 457 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0882  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  27.66 
 
 		 332 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000626988 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2560  radical SAM family protein  25.12 
 
 		 369 aa  51.2  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0538253  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  26.15 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  26.15 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2586  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 318 aa  50.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  23.74 
 
 		 510 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2823  radical SAM family protein  28.99 
 
 		 332 aa  50.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0411588 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3245  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  27.89 
 
 		 382 aa  50.8  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  21.21 
 
 		 450 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 360 aa  50.4  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  21.51 
 
 		 460 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  30.08 
 
 		 450 aa  50.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  21.21 
 
 		 457 aa  50.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2032  radical SAM domain-containing protein  30.6 
 
 		 411 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  28.81 
 
 		 393 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  26.41 
 
 		 401 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 481 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  27.01 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  23.44 
 
 		 399 aa  49.3  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0220  radical SAM family protein  23.67 
 
 		 340 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.4632 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 365 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3361  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  25.24 
 
 		 402 aa  48.5  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.941975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  24.15 
 
 		 330 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3457  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  29.55 
 
 		 339 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.483459 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1017  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 332 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 447 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  25.65 
 
 		 1002 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1745  oxidoreductase  23.67 
 
 		 372 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2734  radical SAM family protein  25.32 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  25.86 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17970  predicted Fe-S oxidoreductase  26.97 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  22.86 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  28.47 
 
 		 458 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  21.85 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 385 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0509  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 359 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294869  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 		 382 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  27.71 
 
 		 346 aa  47.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1494  Radical SAM domain protein  22.86 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>