147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0737 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0737  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 480 aa  1002    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  41.39 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  37.9 
 
 		 487 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1615  Radical SAM domain protein  33.48 
 
 		 464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1714  Radical SAM domain protein  33.97 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.540627  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2894  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 462 aa  255  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00476691  normal  0.460921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2251  radical SAM domain-containing protein  31.39 
 
 		 462 aa  252  9.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.677683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  24.02 
 
 		 476 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  23.03 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  23.59 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  23.03 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  22.75 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  23.66 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  24.94 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  26.84 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  24.37 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  21.98 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  22.95 
 
 		 453 aa  71.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  24.33 
 
 		 470 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2206  radical SAM domain-containing protein  23.37 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000327652  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  23.77 
 
 		 387 aa  67.4  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  23.41 
 
 		 385 aa  67  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  20.67 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  23.4 
 
 		 453 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  23.44 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  23.32 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  22.86 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  20.46 
 
 		 471 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  20.68 
 
 		 457 aa  59.7  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  24.61 
 
 		 381 aa  59.7  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  20.68 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2981  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 477 aa  58.9  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0847138  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  21.51 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  23.36 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1353  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.973606  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  25.11 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  21.96 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  21.32 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  22.07 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  21.41 
 
 		 489 aa  57  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  21.3 
 
 		 473 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  22.6 
 
 		 370 aa  55.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 481 aa  56.2  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  22.47 
 
 		 484 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  22.67 
 
 		 481 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  23.66 
 
 		 397 aa  55.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  21.93 
 
 		 369 aa  55.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 		 518 aa  55.1  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  20.99 
 
 		 368 aa  54.7  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  22.03 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  22.36 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  23.91 
 
 		 280 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1109  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 607 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  32.31 
 
 		 346 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 462 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 344 aa  52.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  28.17 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  21.6 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  20.61 
 
 		 351 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  28.17 
 
 		 442 aa  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  21.02 
 
 		 350 aa  51.2  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  21.07 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  21.01 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  21.01 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 		 326 aa  50.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  21.01 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  21.01 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  21.01 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 		 477 aa  50.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.16 
 
 		 447 aa  50.8  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 		 465 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  23.86 
 
 		 403 aa  50.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  20 
 
 		 370 aa  50.4  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 800 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  23.15 
 
 		 769 aa  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2391  Radical SAM domain protein  23.19 
 
 		 446 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  23.41 
 
 		 370 aa  50.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1446  radical SAM domain-containing protein  23.43 
 
 		 443 aa  50.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.203798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  21.07 
 
 		 385 aa  50.1  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  23.37 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  23.18 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  24.19 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0073  radical SAM domain-containing protein  22.19 
 
 		 356 aa  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  21.01 
 
 		 728 aa  48.5  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  27.22 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0156  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 377 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  22.6 
 
 		 450 aa  48.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 455 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  23.98 
 
 		 453 aa  47.8  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>