91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1109 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1109  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 607 aa  1253    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 397 aa  72  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  24.32 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  23.8 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  21.39 
 
 		 370 aa  67  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  24.21 
 
 		 381 aa  67  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  35.48 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  18.41 
 
 		 380 aa  63.9  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0580  radical SAM domain-containing protein  21.73 
 
 		 389 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.185035  normal  0.0438607 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2577  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 436 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3003  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 436 aa  62  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00234995  hitchhiker  0.0000159012 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2479  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.657358  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 378 aa  60.8  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  28.57 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  20.92 
 
 		 368 aa  60.1  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  20.45 
 
 		 385 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2090  Radical SAM domain protein  21.56 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  29.03 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  20.49 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.72 
 
 		 398 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  23.66 
 
 		 485 aa  56.2  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 800 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.72 
 
 		 398 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1605  radical SAM domain-containing protein  22.09 
 
 		 415 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  20.17 
 
 		 383 aa  55.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0142  Radical SAM domain protein  22.81 
 
 		 477 aa  55.1  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.45 
 
 		 398 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.45 
 
 		 398 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  23.45 
 
 		 398 aa  54.7  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  23.2 
 
 		 438 aa  54.7  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0737  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 480 aa  53.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  28.67 
 
 		 414 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 391 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  22 
 
 		 453 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  26.17 
 
 		 367 aa  51.6  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  22.66 
 
 		 728 aa  51.6  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  23.25 
 
 		 442 aa  51.6  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  23.25 
 
 		 442 aa  51.6  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  27.13 
 
 		 391 aa  51.2  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  27.13 
 
 		 391 aa  51.2  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  24.02 
 
 		 468 aa  50.4  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  23.46 
 
 		 476 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  23.25 
 
 		 476 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  24.1 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0479  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 471 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 403 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  23.25 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  22.97 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 402 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.73 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  21.81 
 
 		 385 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5654  Radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 449 aa  48.9  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150626  normal  0.213395 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  21.81 
 
 		 385 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  21.81 
 
 		 385 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  21.81 
 
 		 385 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  21.81 
 
 		 385 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  21.81 
 
 		 385 aa  47.8  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  21.81 
 
 		 385 aa  47.8  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  19.41 
 
 		 370 aa  47.8  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  22.04 
 
 		 414 aa  47.8  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  21.81 
 
 		 385 aa  47.4  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.25 
 
 		 431 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 397 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  30.63 
 
 		 447 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.19 
 
 		 431 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  21.94 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  21.94 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 345 aa  47  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  19.83 
 
 		 447 aa  47  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1494  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 397 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  21.11 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  20.75 
 
 		 470 aa  46.2  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1624  Radical SAM domain protein  23.78 
 
 		 486 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.197988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  21.98 
 
 		 431 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  26.28 
 
 		 401 aa  46.2  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1340  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 467 aa  46.2  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.768611  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  22.82 
 
 		 477 aa  45.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  20.75 
 
 		 344 aa  45.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  26.8 
 
 		 383 aa  44.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  22.01 
 
 		 439 aa  44.7  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 450 aa  44.3  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0165  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 376 aa  44.3  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.263951  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  25.69 
 
 		 491 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 491 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 491 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 491 aa  44.3  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  20.05 
 
 		 402 aa  44.3  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 491 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 491 aa  44.3  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>