162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1714 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_2894  radical SAM domain-containing protein  72.2 
 
 		 462 aa  702    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00476691  normal  0.460921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1615  Radical SAM domain protein  97.63 
 
 		 464 aa  940    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.193736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1714  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 464 aa  966    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.540627  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2251  radical SAM domain-containing protein  47.54 
 
 		 462 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.677683 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3364  radical SAM domain-containing protein  34.47 
 
 		 484 aa  269  7e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.155713  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0737  radical SAM domain-containing protein  33.97 
 
 		 480 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  30.62 
 
 		 487 aa  233  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  24.39 
 
 		 431 aa  67  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1520  radical SAM domain-containing protein  23.1 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2438  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  29.7 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  20.79 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 		 455 aa  58.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  23.38 
 
 		 476 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  22.16 
 
 		 476 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1457  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1502  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0399675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  22.44 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 476 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0678  radical SAM domain-containing protein  26.29 
 
 		 464 aa  56.6  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.628302  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0069  Radical SAM domain protein  29.55 
 
 		 452 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000122492  hitchhiker  0.00745391 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  25.73 
 
 		 460 aa  55.5  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  28.97 
 
 		 388 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 447 aa  54.7  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  22.55 
 
 		 477 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0467  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.103489  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  25.57 
 
 		 381 aa  54.7  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  21.63 
 
 		 462 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  29.01 
 
 		 387 aa  54.3  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2370  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 462 aa  54.3  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  20.66 
 
 		 394 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  21.69 
 
 		 394 aa  53.9  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  28.12 
 
 		 481 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 		 458 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1396  Radical SAM domain protein  22.88 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.581014  hitchhiker  0.000129983 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  27.71 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  26.57 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 		 453 aa  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  22.69 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  21.32 
 
 		 394 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0669  radical SAM domain-containing protein  29.2 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0393374  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0687  radical SAM domain-containing protein  28.39 
 
 		 481 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  22.69 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1369  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 454 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  22.69 
 
 		 391 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1364  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 		 460 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.458082  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.67 
 
 		 394 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  21.32 
 
 		 394 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  24.74 
 
 		 399 aa  50.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 393 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 368 aa  50.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 468 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 485 aa  50.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  23.96 
 
 		 401 aa  50.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 		 327 aa  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  24.55 
 
 		 380 aa  50.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0865  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1786  Radical SAM domain protein  23.47 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0257396  hitchhiker  0.00364528 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1445  Radical SAM domain protein  28.38 
 
 		 468 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1963  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0417  radical SAM family protein  21.45 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1287  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  29.87 
 
 		 344 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0981  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.820842  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1268  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3055  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.615551  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2930  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2243  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 439 aa  48.5  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0870  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  26.24 
 
 		 483 aa  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2244  radical SAM domain-containing protein  25.22 
 
 		 371 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  23.01 
 
 		 389 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3252  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  25.22 
 
 		 386 aa  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.309315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0969  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  27.42 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1745  oxidoreductase  22.65 
 
 		 372 aa  48.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4047  Radical SAM domain protein  27.17 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1441  Radical SAM domain protein  28.21 
 
 		 474 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5307  radical SAM family protein  25.65 
 
 		 386 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5553  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 386 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.702436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1192  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 332 aa  47.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1494  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1467  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 397 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2284  Radical SAM domain protein  31.39 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00108467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  21.77 
 
 		 450 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1467  radical SAM domain-containing protein  22.27 
 
 		 463 aa  47  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1508  radical SAM domain-containing protein  22.27 
 
 		 463 aa  47  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.322898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  21.76 
 
 		 470 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3658  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  26.61 
 
 		 387 aa  47  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.100669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7158  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  27.42 
 
 		 384 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3768  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnH  27.05 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>