259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5865 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  64.86 
 
 		 872 aa  1145    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  79.78 
 
 		 899 aa  1343    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  100 
 
 		 944 aa  1878    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  63.34 
 
 		 836 aa  1083    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  69.48 
 
 		 857 aa  639    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  61.28 
 
 		 842 aa  1090    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  70.75 
 
 		 881 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  70.16 
 
 		 867 aa  627  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  69.74 
 
 		 875 aa  620  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  69.91 
 
 		 859 aa  618  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  65.98 
 
 		 841 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  67.46 
 
 		 859 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  67.25 
 
 		 859 aa  612  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  67.25 
 
 		 859 aa  612  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  67.32 
 
 		 871 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  67.63 
 
 		 852 aa  608  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  66.05 
 
 		 863 aa  603  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  68.03 
 
 		 860 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  66.22 
 
 		 859 aa  589  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  65.55 
 
 		 856 aa  580  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  65.53 
 
 		 859 aa  580  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  68.28 
 
 		 838 aa  574  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  67.65 
 
 		 884 aa  575  1.0000000000000001e-162  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  62.96 
 
 		 416 aa  506  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  60.78 
 
 		 811 aa  476  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  64.68 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  50.93 
 
 		 820 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  51.84 
 
 		 792 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  48.8 
 
 		 429 aa  379  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  60.53 
 
 		 779 aa  377  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  50.28 
 
 		 800 aa  375  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  54.33 
 
 		 826 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  51.16 
 
 		 418 aa  362  2e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  52.15 
 
 		 435 aa  353  8e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  43.5 
 
 		 392 aa  327  7e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  43.31 
 
 		 841 aa  325  2e-87  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  46.37 
 
 		 453 aa  319  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  42.9 
 
 		 419 aa  317  5e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  49.39 
 
 		 376 aa  314  4.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  44.13 
 
 		 370 aa  313  1e-83  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  43.55 
 
 		 359 aa  313  1e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  43.27 
 
 		 359 aa  311  5e-83  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  42.7 
 
 		 362 aa  311  5e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  50.3 
 
 		 757 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  46.67 
 
 		 380 aa  304  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  41.29 
 
 		 359 aa  302  2e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  45.09 
 
 		 367 aa  302  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  46.07 
 
 		 381 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  45.87 
 
 		 386 aa  295  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  45.68 
 
 		 358 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  45.66 
 
 		 737 aa  288  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  46.15 
 
 		 741 aa  287  5.999999999999999e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  45.86 
 
 		 737 aa  287  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  48.9 
 
 		 419 aa  286  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  45.06 
 
 		 356 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  45.19 
 
 		 365 aa  285  3.0000000000000004e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3326  FO synthase  43.63 
 
 		 372 aa  283  9e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.9768  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  43.35 
 
 		 366 aa  283  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.14 
 
 		 382 aa  282  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  42.51 
 
 		 391 aa  280  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  42.27 
 
 		 380 aa  277  8e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 362 aa  277  9e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  41.39 
 
 		 352 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 		 390 aa  276  1.0000000000000001e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  41.28 
 
 		 352 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  38.48 
 
 		 358 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  40.11 
 
 		 358 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  41.43 
 
 		 352 aa  270  1e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  41.44 
 
 		 384 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  41.44 
 
 		 384 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  41.9 
 
 		 384 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  43.11 
 
 		 398 aa  267  7e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  43.2 
 
 		 329 aa  267  7e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  39.35 
 
 		 376 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  40.66 
 
 		 565 aa  264  4.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  40.81 
 
 		 351 aa  264  8e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  39.54 
 
 		 358 aa  262  2e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  44.06 
 
 		 386 aa  261  4e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  41.62 
 
 		 362 aa  261  5.0000000000000005e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  45.37 
 
 		 331 aa  259  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  45.02 
 
 		 327 aa  258  5e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  41.44 
 
 		 325 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  39.88 
 
 		 362 aa  256  2.0000000000000002e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  47.6 
 
 		 387 aa  244  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  38.78 
 
 		 364 aa  244  7.999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  42.25 
 
 		 368 aa  243  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  38.41 
 
 		 356 aa  243  1e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  42.3 
 
 		 321 aa  243  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  39.24 
 
 		 360 aa  241  5.999999999999999e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  42.61 
 
 		 389 aa  240  8e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  37.46 
 
 		 361 aa  240  1e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  39.76 
 
 		 330 aa  238  4e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  41.34 
 
 		 368 aa  237  8e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  36.02 
 
 		 361 aa  234  8.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.44 
 
 		 393 aa  233  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  39.71 
 
 		 361 aa  230  8e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  41.95 
 
 		 355 aa  229  2e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 		 358 aa  228  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  39.65 
 
 		 358 aa  228  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  37.97 
 
 		 360 aa  227  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>