121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1838 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 331 aa  671    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  65.84 
 
 		 327 aa  441  1e-123  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  61.61 
 
 		 329 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  60.8 
 
 		 565 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  64.15 
 
 		 321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  55.03 
 
 		 330 aa  349  3e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  54.57 
 
 		 325 aa  343  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  49.69 
 
 		 352 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  49.09 
 
 		 352 aa  302  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  50.64 
 
 		 326 aa  301  1e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  47.88 
 
 		 352 aa  297  2e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  48.61 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  47 
 
 		 380 aa  291  2e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  46.41 
 
 		 867 aa  279  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  47.32 
 
 		 881 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  44.67 
 
 		 863 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  46.81 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  46.57 
 
 		 860 aa  272  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  46.11 
 
 		 859 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  47.55 
 
 		 852 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  46.75 
 
 		 836 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 826 aa  269  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  45.78 
 
 		 857 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  41.16 
 
 		 392 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  45.59 
 
 		 875 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  46.75 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  43.66 
 
 		 859 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  43.66 
 
 		 859 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  43.36 
 
 		 859 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  45.34 
 
 		 838 aa  261  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  44.83 
 
 		 859 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  46.95 
 
 		 792 aa  259  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  44.51 
 
 		 859 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  44.51 
 
 		 842 aa  259  6e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  45.42 
 
 		 368 aa  259  6e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  42.86 
 
 		 871 aa  258  9e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  46.25 
 
 		 800 aa  258  9e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  46.13 
 
 		 884 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  42.64 
 
 		 856 aa  257  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  46 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  43.95 
 
 		 820 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  46.37 
 
 		 811 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  44.54 
 
 		 841 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  47.02 
 
 		 393 aa  252  7e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  45.54 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  45.45 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  45.81 
 
 		 386 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.24 
 
 		 872 aa  248  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  42.86 
 
 		 380 aa  239  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  43.44 
 
 		 779 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  43.04 
 
 		 430 aa  235  8e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  45.97 
 
 		 899 aa  233  3e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  39.87 
 
 		 390 aa  233  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  45.37 
 
 		 944 aa  232  6e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.72 
 
 		 741 aa  225  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.74 
 
 		 737 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  43.79 
 
 		 757 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.69 
 
 		 737 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  43.22 
 
 		 841 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  40.06 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  41.3 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  36.45 
 
 		 319 aa  189  7e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  38.3 
 
 		 336 aa  188  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  40.56 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  41.23 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  39.17 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  40.26 
 
 		 325 aa  187  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  27.27 
 
 		 453 aa  72.8  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  25.68 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  29.74 
 
 		 364 aa  61.6  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 348 aa  58.5  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 515 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  24.36 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  26.1 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 353 aa  55.8  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 364 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  24.14 
 
 		 361 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  25.79 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  25.36 
 
 		 395 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 362 aa  53.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  22.76 
 
 		 396 aa  52.8  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 362 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 358 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 361 aa  51.2  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  22.39 
 
 		 394 aa  50.4  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  23.62 
 
 		 384 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 368 aa  50.4  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 		 364 aa  50.1  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  31.13 
 
 		 341 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 358 aa  49.3  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  25.56 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1545  Radical SAM domain protein  25.35 
 
 		 337 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.160602  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  29.23 
 
 		 341 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>